Archenteron
Wenn sich primäre Mesenchymzellen vom vegetalen Pol in der Gastrula ablösen und in den flüssigkeitsgefüllten Hohlraum in der Mitte (das Blastocoel) eindringen, flachen sich die verbleibenden Zellen am vegetalen Pol ab und bilden eine vegetale Platte. Diese wölbt sich in einem als Invagination bezeichneten Prozess nach innen in Richtung Blastocoel. Die Zellen werden weiter umgeschichtet, bis sich die durch die Invagination entstandene flache Vertiefung in einen tieferen, engeren Beutel verwandelt, der vom Endoderm der Gastrula gebildet wird. Diese Verengung und Verlängerung des Archenterons wird durch konvergente Ausdehnung vorangetrieben. Das offene Ende des Archenterons wird als Blastopore bezeichnet.
Die Filopodien – dünne Fasern, die von den Mesenchymzellen gebildet werden -, die in einer späten Gastrula zu finden sind, ziehen sich zusammen, um die Spitze des Archenterons durch das Blastocoel zu ziehen. Das Endoderm des Archenterons verschmilzt mit dem Ektoderm der Blastocoelwand. Zu diesem Zeitpunkt ist die Gastrulation abgeschlossen, und die Gastrula verfügt über einen funktionsfähigen Verdauungsschlauch.