Identifizierung von BATF-Zielgenen, die für seine Funktion bei Immunantworten entscheidend sind

Abstract

BATF, ein immunspezifischer AP-1-Transkriptionsfaktor, reguliert zusammen mit IRF4 und JUNB Gene, die für die Antikörperklassenschalter-Rekombination (CSR) in B-Zellen und für die funktionelle Differenzierung verschiedener CD4+ T-Helfer (Th)-Untergruppen, einschließlich Th2, Th9, Th17 und Tfh-Zellen, wichtig sind. BatfΔZ/ΔZ(KO)-Mäuse weisen Phänotypen auf, die in direktem Zusammenhang mit Defiziten bei den oben genannten Zelltypen stehen. In einem Versuch, die für diese Phänotypen verantwortlichen Veränderungen der Genexpression zu bestimmen, wurde eine RNA-seq-Analyse durchgeführt, um Transkripte in KO- und WT-Maus-B-Zellen zu profilieren. Durch bioinformatische Analysen wurden 47 Gene identifiziert, deren Transkripte in Abwesenheit von BATF entweder über- oder unterrepräsentiert waren. Viele der Transkripte, die in KO-B-Zellen fehlreguliert waren, waren auch in KO-T-Zellen fehlreguliert, was darauf hindeutet, dass diese Gene gemeinsame molekulare Ziele der transkriptionellen Aktivität von BATF sind. Die durch Retroviren vermittelte Reexpression von BATF in den KO-Zellen führte zu einer korrekten Regulierung dieser Zielgene. Darüber hinaus waren BATF-rekonstituierte KO-B-Zellen in der Lage, CSR zu durchlaufen, und naive CD4+ T-Zellen, die BATF reexprimieren, konnten in Th2- und Th17-Untergruppen differenziert werden. Derzeit setzen wir diese Rettungsstrategie mit Retroviren ein, die BATF-Proteine exprimieren, die hinsichtlich ihrer DNA-Bindung, Dimerisierung und Transkriptionseigenschaften modifiziert sind, um die molekularen Parameter besser zu verstehen, die steuern, wie BATF Gensätze in B-Zellen und T-Zellen reguliert. Unser langfristiges Ziel ist es, die Regulierung von BATF für In-vivo-Strategien zur Behandlung von Entzündungen und Autoimmunkrankheiten zu nutzen.