Schwarze Bengalziege

Das Geheimnis des Lebens der weltweit besten und einzigen Rasse der Schwarzen Bengalziege aus Bangladesch wurde durch eine vollständige Genomsequenzierung durch die „Genomics Research Group“ unter der Leitung von Dr. AMAM Zonaed Siddiki, Professor der Abteilung für Pathologie und Parasitologie, Fakultät für Veterinärmedizin der Chittagong Veterinary and Animal Sciences University (CVASU), gelüftet. Die Genomanalyse der Schwarzen Bengalziege hat gezeigt, dass ihr Genom etwa 3,04 gb groß ist, wovon etwa 31,85 % Wiederholungen sind. Obwohl 26.458 Gene in 29 Chromosomen vorhergesagt werden, wurden nur 12.589 Gene annotiert. Darüber hinaus wurde bei 8173 Genen mindestens ein Ontologie-Term gefunden. Eine der Forschungsarbeiten des Projekts wurde von der renommierten Fachzeitschrift BMC der Firma Springer Nature angenommen und veröffentlicht. Ein weiterer Teil der Forschungsarbeit wurde in Mitochondrial DNA Part B der Taylor and Francis Group veröffentlicht, zusätzlich zu allen Daten, die vom NCBI anerkannt wurden. Außerdem wurde die Zusammenfassung der Forschungsarbeit zum ersten Mal auf der „2nd World Conference on Sheep“ vorgestellt, die von der Nanjing Agricultural University organisiert wurde. Um das Projekt erfolgreich durchzuführen, wurden alle Mitglieder des Teams entsprechend geschult. Eines der Teammitglieder, Masum Billah, wurde zur Weiterbildung an das Big-Data-Labor von Professor Dr. Yu Jiang an der Northwest A&F University of China geschickt, ein anderes Mitglied, Kazi Shawrob, an die Mizoram University of India. Die anderen Mitglieder des Teams waren Mahadia Kumkum, Mohammad Atique Ul Alam, Sourav Saha Pritthi, Montaha Chowdhury, Mehedi Hasan Rumi und Md. Sirajul Islam.

Für die Datenanalyse wurde im CVASU ein Hochgeschwindigkeitsrechner mit 128 gb RAM installiert und der Server der University Grants Commission of Bangladesh verwendet. Der größte Teil der Forschung wurde in Bangladesch durchgeführt, aber für einige Teile war ein sehr fortschrittlicher Server erforderlich, der in Australien von Dr. Abdul Baten von der Southern Cross University betrieben wurde.

Obwohl die Sequenzierung des gesamten Genoms von Hilsha und Jute bereits in Bangladesch durchgeführt wurde, ist das Genom der Schwarzen Bengalziege das größte. Das Genom ist die Gesamtheit der Gene oder der genetischen Ausstattung eines Organismus, die für Geburt, Leben und Fortpflanzung notwendig ist. Die Gene enthalten alle Informationen über den Organismus, z. B. wie er entstanden ist und sich entwickelt hat, welche Eigenschaften er hat, wie er wächst und sich in widrigen Situationen schützt. Der Prozess der Gewinnung all dieser Informationen aus den Genen wird als Genomsequenzierung bezeichnet. Die Genomsequenzierung gibt Aufschluss über die genaue Position und Funktion der Gene, die für verschiedene physiologische Aktivitäten von der Geburt bis zum Tod eines Organismus notwendig sind.