Documento de métodoAlcanivorax borkumensis produce un sideróforo extracelular en condiciones de limitación de hierro manteniendo la eficiencia de degradación de hidrocarburos.eficiencia de degradación de hidrocarburos

Las bacterias hidrocarbonoclásticas marinas poseen características genéticas y fisiológicas para utilizar los hidrocarburos como única fuente de carbono y para competir por la captación de nutrientes en hábitats marinos habitualmente carentes de nutrientes. En el presente trabajo hemos estudiado los sistemas de captación de hierro basados en sideróforos en Alcanivorax borkumensis SK2 y su funcionamiento durante la biodegradación de un hidrocarburo alifático, el tetradecano, en condiciones de limitación de hierro. El análisis antiSMASH del genoma de SK2 reveló la presencia de dos operones putativos diferentes de sideróforos sintetasas. La búsqueda de las estructuras centrales predichas indicó que un sideróforo está claramente afiliado a la familia de sideróforos oligopeptídicos complejos que poseen un motivo carboxilo Orn-Ser-Orn, mientras que el segundo es probable que pertenezca a la familia de los sideróforos basados en SA (ácido salicílico).

Al analizar el sobrenadante del cultivo de SK2, se identificó un sideróforo extracelular y se resolvió su estructura. Así, junto con el recientemente descrito anfifílico tetrapéptido sideróforo anfibactina asociado a la membrana, la cepa SK2 produce además un tipo extracelular de molécula quelante de hierro con similitud estructural a las pseudomoninas. El análisis Q-PCR comparativo de las sintetasas de sideróforos demostró su significativa regulación al alza en un medio carente de hierro. Se registraron diferentes patrones de expresión para dos operones durante las fases exponenciales temprana y tardía del crecimiento, lo que sugiere una función diferente de estos dos sideróforos en condiciones de falta de hierro.