Los hermanos Hughes
Después de que Allen tuviera un hijo a los 18 años, los gemelos abandonaron el instituto y pronto empezaron a trabajar en vídeos musicales siendo adolescentes, dirigiendo para artistas como Tone Loc y Tupac Shakur. Su primer largometraje, Menace II Society (1993), se estrenó en el Festival de Cannes. Centrada en la juventud negra marginada, se realizó con un presupuesto de 3,5 millones de dólares cuando tenían 20 años. Tyger Williams escribió el guión y compartió el crédito de la historia con los hermanos. Se convirtió en un éxito tanto de crítica como de taquilla y fue nominada al premio Independent Spirit a la mejor ópera prima. Debido a su experiencia previa en la dirección de vídeos musicales, se convirtieron en el primer dúo de hermanos desde que Jerry y David Zucker obtuvieran una exención del Gremio de Directores de Estados Unidos para poder compartir los créditos como directores.
Su segunda película fue Dead Presidents en 1995. Al igual que su primer largometraje, la película trataba de la sociedad de la clase baja negra, y también estaba protagonizada por Larenz Tate, y se centraba en los veteranos de guerra durante la época de la guerra de Vietnam, de gran carga racial. La película, que se estrenó en el Festival de Cine de la Crítica de Nueva York, no obtuvo tantos beneficios como su primera película. Siguieron a Dead Presidents con American Pimp, un largometraje documental sobre la cultura del proxenetismo clandestino y la explotación de las mujeres. Se estrenó en el Festival de Cine de Sundance de 1999. En un principio se propusieron hacer una adaptación de la novela Pimp de Iceberg Slim, pero otra persona adquirió los derechos. Los hermanos han declarado que el punto de vista de la película se debe en parte a que fueron criados por su madre, que es feminista. Entre un proyecto y otro, filmaron varios anuncios de servicio público contra las armas de fuego.
Aparte de su material anterior, los hermanos Hughes codirigieron From Hell, la adaptación cinematográfica de 2001 de la novela gráfica homónima de Alan Moore sobre los asesinatos de Jack el Destripador en la Inglaterra victoriana, protagonizada por Johnny Depp y Heather Graham. Considerada demasiado violenta y sangrienta por algunos críticos, la película tuvo que ser editada para evitar la clasificación NC-17 de la MPAA. Según la estrella de la película, a veces había desacuerdos entre los gemelos sobre la dirección de la película. Por ejemplo, la cantidad de violencia mostrada fue un punto de contención entre los dos; un hermano pensaba que la brutalidad debía mostrarse, mientras que el otro creía que la violencia implícita sería suficiente.
Su única película juntos desde From Hell de 2001 fue el drama post-apocalíptico Book of Eli para Warner Bros, que se estrenó en enero de 2010.
En 2006, se anunció que los hermanos iban a dirigir The Iceman, una película sobre el asesino en serie Richard Kuklinski, pero finalmente la dirigió Ariel Vromen y se estrenó en 2012. También estaban programados para dirigir una versión cinematográfica de la clásica serie de televisión Kung Fu. En 2010 se anunció que los hermanos iban a dirigir una adaptación de acción real del manga Akira de 1988, pero abandonaron el proyecto en 2011.
Como equipo, Allen suele trabajar con los actores mientras que Albert se encarga de los aspectos técnicos de sus películas, fruto de la experiencia de Albert al tomar clases en la escuela de cine de Los Ángeles City College.