Sobre la definición, nomenclatura y clasificación de las proteínas de los canales de agua (acuaporinas y afines)
Una proteína de canal de agua (PCA) o un canal de agua puede definirse como una proteína transmembrana que tiene una estructura tridimensional específica con un poro que proporciona una vía para la permeación del agua a través de las membranas biológicas. El poro está formado por dos regiones altamente conservadas en la secuencia de aminoácidos, denominadas cajas (o motivos) NPA con tres residuos de aminoácidos (asparagina-prolina-alanina, NPA) y varios aminoácidos circundantes. Los recuadros NPA se han denominado la secuencia «distintiva» de las PCM. Las WCPs son una familia de proteínas que pertenecen a la superfamilia de las Proteínas Intrínsecas de Membrana (MIPs). Además, en la superfamilia MIP (con más de 1000 miembros) también hay proteínas sin actividad de canal. La familia MIP incluye tres subfamilias: las acuaporinas, las acuagliceroporinas y las S-acuporinas. (1) Las acuaporinas (AQP) son canales de agua selectivos o específicos, también denominados por varios autores como acuaporinas «ortodoxas», «ordinarias», «convencionales», «clásicas», «puras», «normales» o «sensu strictu»); (2) Las acagliceroporinas son permeables al agua, pero también a otras moléculas pequeñas no cargadas, en particular el glicerol; esta familia incluye los facilitadores de glicerol, abreviados como GlpFs, de facilitadores de glicerol permeasa. La secuencia «distintiva» de las acuagliceroporinas es el residuo de ácido aspártico (D) en la segunda caja NPA. (3) La tercera subfamilia de WCPs tiene secuencias de aminoácidos poco conservadas alrededor de las cajas NPA, inclasificables a las dos primeras subfamilias. Recomiendo utilizar siempre para esta subfamilia el nombre de S-aquaporinas. También se denominan «superaquaporinas», «acuaporinas con cajas NPA inusuales (o desviadas)», «acuaporinas subcelulares» o «acuaporinas sip-like». También recomiendo utilizar siempre la grafía acuaporina (no acuaporina), y, para varias AQP, la abreviatura AQP seguida inmediatamente por el número, (por ejemplo, AQP1), sin espacio o-que podría crear confusiones con «menos».