Élevage des animaux
Introduction : Ampleur du problème, aperçu et définitions
L’eau est essentielle à la vie humaine, à l’agriculture et à l’élevage, et à la société industrielle moderne. L’absence d’eau empêche l’existence humaine. Les gens doivent avoir accès à des quantités adéquates d’eau ainsi qu’à une eau propre qui ne leur fait pas de mal lorsqu’elle est bue. La quantité et la qualité de l’eau sont toutes deux importantes. La réutilisation de l’eau est courante et, grâce à ce mécanisme, des agents pathogènes humains (d’origine animale, humaine ou environnementale) peuvent être introduits dans l’eau qui peut être utilisée plusieurs fois entre le moment où elle tombe du ciel et celui où elle entre dans la mer. Les maladies d’origine hydrique sont intimement liées non seulement à l’ingestion d’eau ou à l’exposition à l’eau, mais aussi à la façon dont les excréments humains et animaux sont séparés de l’eau et des réserves alimentaires (assainissement), et à la disponibilité d’eau propre pour le lavage des mains et le nettoyage corporel (hygiène).
Les agents pathogènes fécaux, par le biais d’un système d’assainissement inadéquat ou absent, peuvent pénétrer dans les eaux de surface (rivières, lacs et piscines de loisirs) ou dans les eaux souterraines (auxquelles on accède par des puits et des forages) pour infecter de nouveaux hôtes.
Certains agents pathogènes ne survivent pas pendant de longues périodes dans l’eau. D’autres peuvent ne pas atteindre la concentration d’organismes nécessaire pour provoquer une infection de manière fiable (« la dose infectieuse ») s’ils sont dilués dans de grandes masses d’eau. Historiquement, l’homme a souvent compté sur le temps et la dilution pour atténuer les risques de pénétration des eaux usées ou des déchets animaux dans ses réserves d’eau. Toutefois, certains agents pathogènes (comme le choléra) sont bien adaptés à la survie dans les eaux douces ou saumâtres, ou peuvent provoquer des maladies chez l’homme après l’ingestion d’un nombre infime d’entre eux (comme le Cryptosporidium). La croissance des populations mondiales, l’utilisation croissante de l’eau à des fins agricoles et les nouveaux schémas de pénurie d’eau induits par le changement climatique et la pollution ont conduit à un regain d’efforts mondiaux pour fournir de l’eau propre et des installations sanitaires à tout le monde.
Bien plus de 400 organismes ont été documentés pour causer des maladies d’origine hydrique. Dans cet article, nous nous concentrerons sur les principes clés de la transmission et de la prévention, tout en mentionnant des maladies spécifiques importantes si nécessaire. Les maladies hydriques, en tant que groupe, contiennent certaines des maladies les plus importantes historiquement connues de l’homme, telles que la fièvre typhoïde (fièvre entérique), la diarrhée à rotavirus et la maladie pandémique du choléra. Chacune de ces maladies est, ou a été, l’une des principales causes de décès chez l’homme. Les maladies diarrhéiques restent une cause majeure de décès chez les enfants dans le monde. Si la plupart des décès dus à la diarrhée surviennent dans les pays à faible revenu, le risque d’épidémies d’origine hydrique reste une menace constante, même dans les nations plus riches, si les barrières à la contamination de l’eau (telles que l’assainissement et le traitement de l’eau) sont compromises. Il existe de nombreux exemples de défaillances du traitement moderne de l’eau dans les pays « développés » qui ont entraîné des épidémies de maladies d’origine hydrique telles que la gastro-entérite ou l’hépatite A. Si les maladies d’origine hydrique ont le plus grand impact sur les enfants, elles sont tout à fait capables de provoquer des décès et une morbidité importants dans les populations adultes. Par exemple, lorsque le choléra a été réintroduit en Amérique du Sud au début des années 1990, de nombreux adultes sont morts, choquant la sensibilité de sociétés où les décès d’enfants, mais pas d’adultes, étaient courants.
Les estimations récentes de l’Organisation mondiale de la santé (OMS, 2013), qui font autorité, sont que l’eau insalubre et le manque d’assainissement de base entraînent environ 760 000 décès par an chez les enfants de moins de 5 ans. Ce chiffre représente une amélioration significative par rapport aux 2,2 millions de décès estimés, y compris chez les adultes mais surtout chez les enfants, dus à des maladies diarrhéiques en 1998. Prüss-Üstün et Corvalán (2006) ont estimé qu’au moins 88% des épisodes diarrhéiques dans le monde sont attribuables à une eau, un assainissement et une hygiène de mauvaise qualité. L’accent mis sur la prévention par la fourniture de ces services est donc un objectif évident. Ces progrès peuvent être suivis en contrôlant l’incidence de syndromes cliniques tels que les maladies diarrhéiques ou la typhoïde. Des études récentes ont montré que ces progrès varient considérablement d’un pays à l’autre, et que les trajectoires suivies par les différents pays au fil du temps peuvent être utilisées pour identifier les pays qui ont besoin de ressources supplémentaires ou d’un renforcement de leurs capacités.
Approximativement 660 millions de personnes, soit 9% de la population mondiale, n’ont pas accès à une source d’eau potable « améliorée ». En 1990, ce chiffre était de 24%, l’accès à une eau améliorée s’est donc nettement amélioré (UNICEF, 2015). Une source d’eau améliorée peut être aussi simple qu’un puits de forage, une conduite d’eau publique partagée par une communauté, un puits ou une source protégée, ou de l’eau de pluie collectée. En soi, une eau améliorée ne signifie pas une eau microbiologiquement sûre et potable. Les approvisionnements en eau améliorés ne répondent pas nécessairement aux critères modernes de l’eau potable, mais ils peuvent représenter des améliorations substantielles par rapport aux sources d’eau de surface ouvertes, car ils réduisent souvent le risque de maladies d’origine hydrique. En effet, un certain nombre d’études récentes ont montré que l’eau courante est souvent contaminée. Il est approprié de considérer l’eau améliorée comme étant retenue ou distribuée par une structure améliorée, plutôt que de la considérer sur le continuum microbiologique allant de l’eau insalubre à l’eau saine. Les deux domaines (structurel et microbiologique) peuvent se croiser. Par exemple, les forages sont souvent une source d’eau améliorée microbiologiquement propre parce que le sol agit comme un filtre pour éliminer les agents pathogènes infectieux.
En revanche, beaucoup moins de progrès ont été réalisés en matière d’assainissement au cours des 25 dernières années. En 2004, plus de 2 milliards de personnes n’avaient pas accès à des installations sanitaires de base (Prüss-Üstün et Corvalán, 2006). En 2015, l’UNICEF estimait que 13 % de la population mondiale pratiquait encore la défécation en plein air et que 10 % supplémentaires utilisaient des installations sanitaires non améliorées. Dans ces circonstances, l’environnement immédiat est contaminé par les matières fécales, et toute pluie peut balayer les matières fécales humaines (ou animales) dans les réserves d’eau. Le défi de l’élimination des maladies d’origine hydrique, en particulier dans les zones urbaines pauvres densément peuplées et les populations rurales dispersées, reste important, malgré les améliorations récentes.
Dans une quarantaine de pays où surviennent 90 % des décès d’enfants, les principales causes de décès sont la diarrhée, la pneumonie, le paludisme et les troubles néonatals. De nombreux décès néonatals sont dus à des infections, dont certaines sont liées à l’hygiène de la peau. L’eau propre est importante non seulement pour l’eau potable, mais aussi parce qu’elle permet de pratiquer des pratiques hygiéniques connexes, comme le lavage des mains. Le lavage des mains au savon réduit non seulement les épisodes diarrhéiques de plus de 50 %, mais aussi les épisodes de pneumonie dans une proportion similaire (Luby et al., 2005). Cela s’explique par le fait que de nombreuses maladies respiratoires se propagent par des fomites dans le cadre de la transmission main-bouche, ce qui peut être abrogé par le lavage des mains. Les mesures qui éliminent les maladies d’origine hydrique classiquement reconnues comme la diarrhée ont des effets importants sur d’autres maladies transmissibles comme les infections respiratoires virales et le trachome. En effet, il y a 100 ans, la communauté de la santé publique reconnaissait largement que pour chaque cas de typhoïde évité par le traitement de l’eau ou l’assainissement, entre 3 et 10 autres décès pouvaient être évités (le phénomène de Mills-Reincke ; voir la discussion ci-dessous).
Les agents pathogènes bactériens tels que Salmonella, Shigella, Escherichia coli et Campylobacter sont à l’origine d’une grande partie du fardeau des maladies d’origine hydrique. D’autres maladies humaines à fort impact (virales, bactériennes et parasitaires), telles que l’hépatite A, l’amibiase, les calicivirus, la leptospirose, la polio et les autres entérovirus, la schistosomiase, la giardiase et la cryptosporidiose sont également transmises par l’eau. Ces maladies ont en commun le fait que l’eau sert de véhicule pour transporter les agents pathogènes d’autres humains, d’autres animaux ou de l’environnement vers de nouveaux hôtes humains. Une fois qu’ils sont infectés par les organismes présents dans l’eau contaminée, ils peuvent à leur tour servir de source d’infection pour d’autres personnes. L’eau peut également servir de site de multiplication d’une maladie liée à l’eau, comme pour la schistosomiase, où le parasite se multiplie obligatoirement dans les escargots associés à l’eau avant de pouvoir infecter l’homme.
Dans cet article, nous séparons les maladies liées à l’eau de celles pour lesquelles un vecteur de la maladie nécessite de l’eau mais pas l’agent pathogène, comme les moustiques qui transmettent le paludisme. Il convient toutefois de noter que ces deux types de maladies sont liés sur le plan social et environnemental, puisque la construction d’un réservoir pour améliorer l’accès à l’eau potable peut fournir de nouveaux habitats aux vecteurs de maladies. De nombreuses autorités divisent les infections liées à l’eau en trois catégories : les infections « d’origine hydrique » (l’agent pathogène est ingéré, comme la typhoïde ou le choléra) ; les infections « lavées à l’eau » ou « rares en eau » (transmission de personne à personne en raison du manque d’eau pour l’hygiène) ; les infections « à base d’eau » (transmission par un hôte intermédiaire aquatique, comme la schistosomiase) ; et les infections « à insectes vecteurs liés à l’eau » (transmission par des insectes qui se reproduisent dans l’eau ou piquent à proximité). Ces distinctions sont des constructions intellectuelles utiles, mais dans la pratique les divisions sont parfois moins claires, comme expliqué ci-dessous. En effet, la construction de réservoirs est associée à l’augmentation de l’incidence du paludisme et de la schistosomiase.
Une maladie qui pénètre dans une population par l’eau peut ensuite se propager par d’autres voies, par transmission de personne à personne, ou par contamination des cultures par les eaux usées. De même, une maladie qui se propage d’abord par contact de personne à personne peut ensuite pénétrer dans les réserves d’eau par le flux fécal, puis devenir hydrique. La même maladie peut être d’origine hydrique, alimentaire et se transmettre directement de personne à personne. Lorsqu’on examine les maladies d’origine hydrique, une perspective écologique est souvent utile pour comprendre le réseau complexe de relations qui existe entre les humains et ces maladies. L’une des raisons pour lesquelles le contrôle des maladies d’origine hydrique est si important est qu’il peut également diminuer la probabilité d’une transmission ultérieure de personne à personne ou par voie alimentaire.
Il est également utile de comprendre que les maladies d’origine hydrique sont liées aux comportements humains et à l’infrastructure locale. Certaines maladies d’origine hydrique, comme les infections parasitaires que sont la schistosomiase et la dracunculose, nécessitent que les humains aient un contact direct peau dans l’eau (dermique) avec des plans d’eau où vivent les formes infectieuses des parasites (transmission » par l’eau « ). Dans le monde entier, ce contact est dû en grande partie à la nécessité pour les gens de collecter de l’eau pour l’usage domestique, pour se livrer à des activités agricoles et pour se baigner ou se baigner à des fins récréatives. C’est dans ces circonstances qu’un approvisionnement en eau amélioré – tel que l’eau courante provenant d’un réservoir – peut protéger les gens de la transmission des maladies. Par exemple, la fourniture d’eau courante ou de puits (formes d’infrastructures) dans les communautés peut éviter aux enfants et aux autres personnes de devoir aller chercher de l’eau à la main dans des rivières ou des eaux de surface infectieuses. Cependant, il est peu probable que cela affecte le désir normal des enfants dans un climat chaud de jouer dans de l’eau potentiellement contaminée (formes de comportement).