Archentéron
Alors que les cellules du mésenchyme primaire se détachent du pôle végétal dans la gastrula et pénètrent dans la cavité remplie de fluide au centre (le blastocœle), les cellules restantes au pôle végétal s’aplatissent pour former une plaque végétale. Celle-ci se plie vers l’intérieur, en direction du blastocoel, selon un processus appelé invagination. Les cellules continuent à être réarrangées jusqu’à ce que la dépression peu profonde formée par l’invagination se transforme en une poche plus profonde et plus étroite formée par l’endoderme de la gastrula. Ce rétrécissement et l’allongement de l’archentéron sont entraînés par l’extension convergente. L’extrémité ouverte de l’archentéron est appelée le blastopore.
Les filopodes – fines fibres formées par les cellules du mésenchyme – que l’on trouve dans une gastrula tardive se contractent pour entraîner l’extrémité de l’archentéron à travers le blastocœle. L’endoderme de l’archentéron va fusionner avec l’ectoderme de la paroi du blastocoele. À ce stade, la gastrulation est terminée, et la gastrula possède un tube digestif fonctionnel.