Oxydation anaérobie de l’ammonium (anammox) dans différents écosystèmes naturels

L’anammox (oxydation anaérobie de l’ammonium), qui est une réaction qui oxyde l’ammonium en diazote gazeux en utilisant le nitrite comme accepteur d’électrons dans des conditions anoxiques, a été une découverte importante dans le cycle de l’azote. Cette réaction est médiée par un groupe spécialisé de bactéries de type planctomycètes qui ont été découvertes pour la première fois dans des écosystèmes artificiels. Par la suite, de nombreuses études ont fait état de la distribution omniprésente des bactéries anammox dans divers habitats naturels, y compris les sédiments et les colonnes d’eau marins anoxiques, les sédiments et les colonnes d’eau d’eau douce, les écosystèmes terrestres et certains écosystèmes spéciaux, tels que les réservoirs pétroliers. Des études antérieures ont estimé que le processus d’anammox est responsable de 50 % de la perte d’azote marin. Récemment, il a été signalé que le processus anammox était responsable de 9 à 40 % et de 4 à 37 % des pertes d’azote dans les lacs intérieurs et les sols agricoles, respectivement. Ces résultats indiquent le grand potentiel du processus d’anammox dans les écosystèmes d’eau douce et terrestres. La distribution de différentes bactéries anammox et leur contribution à la perte d’azote ont été décrites dans différents habitats naturels, démontrant que le processus anammox est fortement influencé par les conditions environnementales locales. La présente mini-revue résume les connaissances actuelles sur la distribution écologique des bactéries anammox, leur contribution à la perte d’azote dans divers écosystèmes naturels et les effets des principaux facteurs d’influence sur le processus anammox.