A vízcsatorna-fehérjék (aquaporinok és rokonai)

A vízcsatorna-fehérje (WCP) vagy vízcsatorna olyan transzmembránfehérje, amely specifikus háromdimenziós szerkezetű pórussal rendelkezik, amely utat biztosít a biológiai membránokon keresztüli vízpermeációhoz. A pórust az aminosav-szekvencia két erősen konzervált régiója, az úgynevezett NPA-dobozok (vagy motívumok) alkotják, amelyekben három aminosavmaradék (aszparagin-prolin-alanin, NPA) és több környező aminosav található. Az NPA-dobozokat a WCP-k “jellegzetes” szekvenciájának nevezik. A WCP-k a Membrane Intrinsic Proteins (MIPs) szupercsaládba tartozó fehérjék családja. Ezenkívül a MIP szupercsaládban (amelynek több mint 1000 tagja van) vannak olyan fehérjék is, amelyeknek nincs csatornaaktivitásuk. A WCP család három alcsaládot foglal magában: aquaporinok, aquagliceroporinok és S-aquaporinok. (1) Az aquaporinok (AQP-k) vízszelektív vagy specifikus vízcsatornák, különböző szerzők “ortodox”, “közönséges”, “hagyományos”, “klasszikus”, “tiszta”, “normál” vagy “sensu strictu” aquaporinoknak is nevezik); (2) Az aquagliceroporinok a víz, de más kis töltés nélküli molekulák, különösen a glicerin számára is áteresztőek; ebbe a családba tartoznak a glicerol facilitátorok, rövidítve GlpF-ek, a glycerol permeáz facilitátorokról. Az aquagliceroporinok “jellegzetes” szekvenciája a második NPA dobozban lévő aszparaginsav-maradék (D). (3) A WCP-k harmadik alcsaládja kevéssé konzervált aminosav-szekvenciával rendelkezik az NPA-dobozok körül, az első két alcsaládhoz nem sorolható. Javaslom, hogy erre az alcsaládra mindig az S-aquaporinok nevet használjuk. Nevezik őket még “szuperakvaporinoknak”, “szokatlan (vagy deviált) NPA-dobozokkal rendelkező akvaporinoknak”, “szubcelluláris akvaporinoknak” vagy “szifonszerű akvaporinoknak” is. Javaslom továbbá, hogy mindig az aquaporin (nem aquaporin) helyesírást használjuk, és a különböző AQP-k esetében az AQP rövidítést, amelyet közvetlenül a szám követ, (pl. AQP1), szóköz vagy – ami összetéveszthető a “mínusz” szóval – szóköz nélkül.