Aminopeptidáz

BY admin
|

  • 1 Funkció
  • 2 Aminopeptidáz Aeromonas proteolyticából
  • 3 S. griseus aminopeptidáz
  • 4 Aminopeptidázok 3D szerkezetei

Funkció

Aminopeptidázok (AP) (EC 3) a fehérjék emésztésében részt vevő fém – többnyire Zn-függő enzimek. A citoszol AP (Cyt-AP), a deblokkoló AP (DAP) és az AP N (APN) eltávolítja az N-terminális aminosavakat. Az AP-ket az általuk hidrolizált aminosav alapján osztályozzák. Az AP további típusai:

  • Hidegen aktiválódó AP (Col-AP)
  • Hőstabil AP Thermus thermophilusból (AmpT)
  • AP Staphylococcus aureusból (AmpS)
  • SGAP Stereomyces griseusból. Lásd részletesen: Streptomyces griseus Aminopeptidáz (SGAP).
  • Az alanin aminopeptidázt aminopeptidáz N-nek nevezik. Lásd részletesen: Aminopeptidáz N.

Aminopeptidázok egy N-terminális aminosav felszabadítását katalizálják egy peptidből, amidból vagy arilamidból. A béta-peptidil AP (BapA) N-terminális β-homoaminosavat hasít 2-6 hosszúságú peptidekből.

Aminopeptidáz Aeromonas proteolytica

Az Aeromonas proteolytica

A , a hidroláz szelektív gátlásáról számolnak be származékokkal. A 8-HQ-alapú Zn2+ fluorofórokkal kapcsolatos eredményeink alapján feltételeztük, hogy a 8-HQ-származékok képesek a Zn2+ enzimek, különösen a dinukleáris Zn2+ hidrolázok specifikus inhibitoraként működni. A 8-HQ-származékok AAP elleni gátlási vizsgálatai feltárták, hogy a 8-HQ és az 5-szubsztituált 8-HQ′-k kompetitív inhibitorok az AAP számára 0,16-29 μM gátlási állandóval (Ki) pH 8,0 mellett. (1,3 Å felbontás), valamint e szerek AAP-pal végzett fluoreszcencia-titrálásai megerősítették, hogy , amelyben az AAP aktív centrumában és a (PDB-kód: 3vh9). szabad AAP (zöld színű), amely Zn2+ -hoz kötött vízmolekulát (H2O vagy OH-; piros gömb) tartalmazó (1rtq) két Zn2+ és AAP-8-HQ komplex (darkmagenta, 3vh9) hidat képez. A két Zn2+ magenta gömbként van ábrázolva.

S. griseus aminopeptidáz

A S. griseus aminopeptidáz (SGAP) az N-terminális aminosavat hasítja le egy peptidről vagy fehérjéről, és specifikus a nagyobb hidrofób savakra, különösen a leucinra. Nem történik hasítás, ha a következő maradék prolin.

Az enzim két Zn2+ iont tartalmaz, amelyek közül az egyik ionhoz a His85 és Asp160, a másik ionhoz pedig a Glu132 és His247 ligandumok. Az Asp97 közös ligandum mindkét ionhoz. A foszfát anionnak látszó anyag mindkét cinkatomhoz kötődik, és helyettesíti az ebben az enzimosztályban általában megtalálható vízmolekulát/hidroxidiont. Lásd az SGAP részleteit a Streptomyces griseus Aminopeptidáz (SGAP) című cikkben.

Aminopeptidázok 3D szerkezetei

Aminopeptidázok 3D szerkezetei

.