Axénikus
A mikroorganizmusok axénikus kultúráit általában egy meglévő kevert kultúra szubkultúrájával állítják elő. Ez magában foglalhatja egy hígítási sorozat alkalmazását, amelyben egy kultúrát egymás után hígítanak olyan mértékben, hogy a részminták csak néhány egyedet tartalmaznak, ideális esetben csak egyetlen egyedet (aszexuális fajok esetében). Ezeket a részkultúrákat addig hagyják növekedni, amíg az őket alkotó szervezetek azonossága meg nem állapítható. A kizárólag a kívánt szervezetből álló kultúrák kiválasztása adja az axén kultúrát. A szubkultúra kiválasztása magában foglalhatja a célszervezet kézi mintavételét is egy egyébként kevert kultúra egy nem szennyezett növekedési frontjából, és ezt használják az inokulumforrásként a szubkultúra számára.
Az axén kultúrákat általában rutinszerűen ellenőrzik annak biztosítása érdekében, hogy axének maradjanak. A mikroorganizmusok esetében az egyik szokásos megközelítés az, hogy a kultúrából mintát terítenek egy agarlemezre, és ezt meghatározott ideig inkubálják. Az agarnak olyan dúsított táptalajnak kell lennie, amely támogatja a gyakori “szennyező” organizmusok növekedését. Az ilyen “kontamináló” organizmusok ez idő alatt a lemezen fognak növekedni, azonosítva a már nem axén kultúrákat.