Capra nera del Bengala
Il mistero della vita della migliore e unica razza al mondo di capra nera del Bengala del Bangladesh è stato rivelato attraverso il sequenziamento dell’intero genoma dal “Genomics Research Group” guidato dal Dr. AMAM Zonaed Siddiki, professore del Dipartimento di Patologia e Parassitologia, Facoltà di Medicina Veterinaria della Chittagong Veterinary and Animal Sciences University (CVASU). L’analisi del genoma della capra del Bengala nero ha dimostrato che la dimensione del suo genoma è di circa 3,04 gb di cui circa il 31,85% sono ripetizioni. Anche se si prevede che ci siano 26.458 geni in 29 cromosomi, l’annotazione della struttura genica di soli 12.589 geni è stata fatta. Inoltre, almeno un termine ontologico è stato trovato tra 8173 geni. Attualmente, uno dei lavori di ricerca del progetto è stato accettato e pubblicato dalla rinomata rivista scientifica BMC sotto la società Springer Nature. Un’altra parte della ricerca è stata pubblicata su Mitochondrial DNA Part B di Taylor and Francis Group, oltre a tutti i dati riconosciuti da NCBI. Inoltre, mentre la ricerca era in corso, il suo abstract è stato presentato per la prima volta in “The 2nd World Conference on Sheep” organizzato dalla Nanjing Agricultural University. Per condurre il progetto con successo, tutti i membri del team sono stati addestrati di conseguenza. Per l’ulteriore formazione, uno dei membri del team, Masum Billah, è stato inviato al Big Data Laboratory del Professor Dr. Yu Jiang nella Northwest A&F University of China e un altro membro, Kazi Shawrob, è stato inviato alla Mizoram University of India. Gli altri membri del team erano Mahadia Kumkum, Mohammad Atique Ul Alam, Sourav Saha Pritthi, Montaha Chowdhury, Mehedi Hasan Rumi e Md. Sirajul Islam.
Per l’analisi dei dati, un computer ad alta velocità di 128 gb RAM è stato installato nel CVASU ed è stato utilizzato il server della University Grants Commission del Bangladesh. La maggior parte della ricerca è stata condotta in Bangladesh, ma per alcune parti è stato necessario un server molto avanzato che è stato condotto in Australia dal Dr. Abdul Baten della Southern Cross University.
Anche se il sequenziamento dell’intero genoma di Hilsha e Jute è stato fatto prima in Bangladesh, la dimensione del genoma della capra nera del Bengala è la più grande. Il genoma è l’insieme completo dei geni o del corredo genetico presente in un organismo che è necessario per la nascita, la vita e la riproduzione. I geni contengono tutte le informazioni dell’organismo, come ad esempio come è nato e si è evoluto, quali sono le sue caratteristiche, come cresce e si protegge in situazioni avverse. Il processo per ottenere tutte queste informazioni dai geni si chiama sequenziamento del genoma. Il sequenziamento del genoma dice la posizione esatta e la funzione dei geni che sono necessari per diverse attività fisiologiche dalla nascita alla morte di un organismo.