Trascrizione naturale antisenso da una prospettiva comparativa☆

I trascritti naturali antisenso (NATs) possono interferire con l’espressione dei trascritti senso complementari con una specificità squisita. Abbiamo precedentemente clonato i NATs dei loci Slc34a (che codificano i trasportatori di Na-fosfato) dal pesce e dal topo. Qui riportiamo la clonazione di un NAT umano legato a SLC34A1 che rappresenta un trascritto PFN3 con splicing alternativo (Profilin3). Il trascritto è prevalentemente espresso nei testicoli. Il confronto filogenetico suggerisce due meccanismi distinti che producono Slc34a-related NATs: Splicing alternativo di un trascritto da un gene codificante la proteina a valle (Pfn3, umano/mouse) e trascrizione dal promotore bidirezionale (Rbpja, zebrafish). L’analisi dell’espressione ha suggerito una regolazione indipendente degli mRNA Slc34a complementari. L’analisi di loci umani/mouse selezionati a caso e trascritti in modo bidirezionale ha rivelato una limitata conservazione filogenetica e una regolazione indipendente dei NATs. Sono stati ridotti sui cromosomi X e raggruppati in regioni che sfuggono all’inattivazione. La struttura del locus e il modello di espressione suggeriscono un meccanismo di regolazione NATs-associato nel testicolo non correlato al ruolo fisiologico della proteina codificata dal trascrittore di senso.