アミノペプチダーゼ

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  • 1 機能
  • 2 Aeromonas proteolytica由来のアミノペプチダーゼ
  • 3 S． griseus aminopeptidase
  • 4 Aminopeptidaseの立体構造

Function

Aminopeptidases (AP) (EC 3) は金属-主に亜鉛依存性の酵素で、タンパク質を消化することに関与している。 細胞質AP（Cyt-AP）、脱ブロック化AP（DAP）、AP N（APN）はN-末端アミノ酸を除去する。 APは、加水分解するアミノ酸によって分類される。 その他のAPとしては、

  • Cold-activated AP (Col-AP)
  • Thermus thermophilus由来の熱安定AP (AmpT)
  • Staphylococcus aureus由来のAP (AmpS)
  • Stereomyces griseus由来のSGAPが存在する。 詳細は、Streptomyces griseus Aminopeptidase (SGAP)を参照。
  • Alanine aminopeptidaseは、Aminopeptidase Nと呼ばれる。詳細は、Aminopeptidase Nを参照。

Aminopeptidaseはペプチド、アミドまたはアリールアミンからN末端のアミノ酸を放出する触媒である。 β-ペプチジルAP（BapA）は長さ2～6のペプチドからN末端のβ-ホモアミノ酸を切断する。

Aeromonas proteolytica由来のアミノペプチダーゼ

誘導体による, a hydrolaseの選択的阻害が報告された。 8-HQ系Zn2+蛍光体に関する知見から、8-HQ誘導体はZn2+酵素、特に二核Zn2+ヒドロラーゼの特異的阻害剤として機能する可能性があると推測された。 8-HQ誘導体のAAPに対する阻害試験を行った結果，8-HQおよび5-置換8-HQ′はAAPに対して競合阻害剤であり，pH8.0における阻害定数（Ki）は0.16-29μMであった． (AAPの活性部位とAAP-8-HQ複合体（PDBコード：3vh9）には、Zn2+と結合した水分子（H2OまたはOH-；赤い球）（1rtq）を含むフリーAAP（緑色）とZn2+を2つ橋渡ししているAAP-8-HQ（濃いマゼンタ、3vh9）であることを蛍光の滴定とともに確認することができる。）

S. griseus aminopeptidase

S. griseus aminopeptidase (SGAP) はペプチドまたはタンパク質からN末端のアミノ酸を切断し、大きな疎水性の酸、特にロイシンに特異的である。

酵素の中には2つのZn2+イオンがあり、一方のイオンにはHis85とAsp160が、もう一方のイオンにはGlu132とHis247がリガンドとして作用する。 Asp97は両方のイオンに共通のリガンドである。 リン酸アニオンと思われるものが両方の亜鉛原子に結合しており、このクラスの酵素に通常見られる水分子／水酸化物イオンに置き換わっている。 SGAPの詳細はStreptomyces griseus Aminopeptidase (SGAP).

Aminopeptidaseの立体構造

Aminopeptidase 3D structures

で見て下さい。