ブラックベンガルヤギ

チッタゴン獣医動物科学大学（CVASU）獣医学科病理・寄生虫学教授のAMAM Zonaed Siddiki博士率いる「ゲノミクス研究グループ」により、世界最高で唯一のバングラデシュの品種、ブラックベンガルヤギの生命の謎が全ゲノム配列決定により明らかにされました。 クロベンガルヤギのゲノム解析の結果、ゲノムサイズは約3.04gbで、そのうち約31.85%が反復配列であることが判明しました。 29本の染色体に26,458個の遺伝子があると予測されていますが、遺伝子構造アノテーションは12,589個にとどまっています。 また、8173個の遺伝子から少なくとも1つのオントロジー用語が見つかっている。 現在、このプロジェクトの研究論文の1つが、Springer Nature社傘下の著名な科学雑誌BMCに受理され、出版されています。 また、Taylor and Francis GroupのMitochondrial DNA Part Bに掲載されたほか、すべてのデータがNCBIで認識されています。 また、研究を進める中で、南京農業大学主催の「第2回世界羊会議」において、その要旨が初めて発表された。 このプロジェクトを成功させるために、チームメンバー全員に適切なトレーニングを行った。 チームメンバーの一人、Masum Billahは中国西北甲&F大学のYu Jiang教授のビッグデータ研究室に、Kazi ShawrobはインドMizoram大学に派遣され、さらなるトレーニングを受けました。 他のメンバーは、Mahadia Kumkum、Mohammad Atique Ul Alam、Sourav Saha Pritthi、Montaha Chowdhury、Mehedi Hasan Rumi、そしてMd. Sirajul Islamです。

データ分析には、128gb RAMの高速コンピュータをCVASUに設置し、バングラデシュの大学助成委員会のサーバーを使用した。 334>

バングラデシュではヒルシャとジュートの全ゲノム配列決定が以前から行われていたが、ブラックベンガルヤギのゲノムサイズが最大であった。 ゲノムとは、生物の誕生、生活、生殖に必要な遺伝子や遺伝子の完全な集合のことである。 遺伝子には、その生物がどのように誕生し進化してきたか、どのような特徴を持っているか、どのように成長し不利な状況下で身を守るかなど、その生物のすべての情報が含まれています。 これらの情報を遺伝子から得ることをゲノム解読といいます。 ゲノム解読により、生物の誕生から死までのさまざまな生理的活動に必要な遺伝子の正確な位置と働きが明らかになります

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