EMBL – European Molecular Biology Laboratory

沈降速度実験から得られる沈降係数や拡散係数から、タンパク質の形状や立体構造、高分子間の相互作用に関する情報を得ることができます。 特に沈降係数は、タンパク質のコンフォメーションの変化をモニターするのに有効である。 得られたタンパク質またはタンパク質複合体の全体的な形状のモデルを電子顕微鏡で得られた画像と比較し、それらの画像が溶液中のこれらの粒子の挙動にどの程度適用できるかを評価することができる。 しかし、107M-1を大きく超えるような結合過程も研究することができます。 この装置は、真空下でタンパク質試料を制御された速度と温度で回転させながら、設定された時間に濃度分布を記録します。 ローターによっては、60,000rpm(250,000×gに相当)まで回転させることができます。 測定には、高い重力場に耐え、試料に光を通すことができる特殊なセルが使用される。 実際の試料は、2枚の石英窓で挟まれたセクター型の空洞に置かれる(図1参照)。 この空洞は、アルミニウム合金や強化エポキシでできたセンターピースに設置されている。 ダブルセクターセルは、試料溶媒の吸光度を補正するために使用されます。 これらのセルは、沈降係数の差や拡散係数の測定も可能にします。 センターピースの光路長は3~12mmで、波長を選択できるため、幅広い濃度範囲の試料を検査することができます。 セルの組み立て方は、組み立てプロトコール

をご覧ください。