Apoptotic protease activating factor-1 (Apaf-1)
Apoptose is een vorm van geprogrammeerde celdood in meercellige organismen. Het disfunctioneren ervan speelt een cruciale rol bij verschillende ziekten bij de mens, zoals kanker en neurologische degeneratieve stoornissen. Tijdens het apoptoseproces wordt een complex, het apoptosoom, gevormd uit apoptotic protease activating factor-1 (Apaf-1), procaspase-9, en cytochroom c/dATP. Het apoptosoom bestaat uit zeven moleculen Apaf-1 die in een symmetrische, wielvormige structuur zijn gerangschikt. Apaf-1 bevat een N-terminaal caspase rekruteringsdomein (CARD), dat verantwoordelijk is voor het rekruteren van caspase-9, een nucleotidebindend oligomerisatiedomein (NOD), en 13 WD40-herhalingen, waarvan gedacht wordt dat ze interageren met cytochroom c. Oligomerisatie van Apaf-1 leidt tot auto-activatie van procaspase-9, dat op zijn beurt caspase-3 klieft, wat uiteindelijk celdood veroorzaakt. De structuur van het apoptosoom vormt dus een cellulair “doodsrad”. In veel celtypes is het apoptosoom niet nodig voor stress-geïnduceerde apoptose en dient het om de caspase cascade te versterken in plaats van te initiëren, en moet het in bepaalde celtypes belangrijker zijn.