Arabinogalactaan
Het reducerende uiteinde van microbieel arabinogalactaan bestaat uit de eindsequentie →5)-D-Galf-(1→4)-L-Rhap-(1→3)-D-GlcNAc. Binnen de functionele groep van het peptidoglycan wordt ook een muramyl-6-P aangetroffen. Het mycolylarabinogalactaan van mycobacteriën is aan het peptidoglycan gehecht door de actinomycetspecifieke diglycosylfosforylbrug, L-Rhap-(1→3)-D-GlcNAc-(1→P).
Arabinogalactaan bevat een galactanketen, met afwisselend 5-gekoppelde β-D-galactofuranosyl- (Galf) en 6-gekoppelde β-D-Galf-residuen. De arabinan-ketens zijn gehecht aan C-5 van sommige van de 6-gekoppelde Galf-residuen. Er zijn drie belangrijke structurele domeinen voor arabinan. Het eerste is een domein dat bestaat uit lineaire 5-gekoppelde α-D-Araf residuen. Het tweede is een domein met vertakte 3,5-gekoppelde α-D-Araf-residuen gesubstitueerd met 5-gekoppelde α-D-Araf-eenheden op beide vertakte posities, en het derde is een terminaal niet-reducerend domein voor eind-rabinan bestaande uit een 3,5-gekoppeld α-D-Araf-residu gesubstitueerd op beide vertakte posities met het disacharide β-D Araf-(1→2)- α-D-Araf. Deze drie arabinan ketens zijn aan het galactan gehecht op de residuen 8, 10 en 12.
Het niet-reducerende uiteinde van arabinogalactan is covalent gehecht aan de mycolzuren van het buitenmembraan. De hydrofobiciteit van mycolzuren vormt een barrière voor het binnendringen van geneesmiddelen. Bovendien is het mycolyl-aprabinogalactaanpeptidoglycan verantwoordelijk voor aspecten van de pathogenese van ziekten en voor een groot deel van de antilichaamrespons bij infecties. De mycolylsubstituenten zijn selectief en gelijk verdeeld over de 5-hydroxylfuncties van de terminale en de voorlaatste 2-gekoppelde Araf-residuen. De mycolylresiduen zijn geclusterd in groepen van vier op de niet-reducerende eindpentaarabinosyleenheid (β-Araf-(1→2)-α-Araf)2-3,5-α-Araf . De meerderheid (66%) van de pentaarabinosyleenheden wordt dus gesubstitueerd door mycolzuren, waardoor de minderheid (33%) beschikbaar blijft voor interactie met het immuunsysteem.
Bijna één van de drie arabinosylketens die aan de galactanketen vastzitten, bevat succinylgroepen. Hoewel één succinylgroep het meest voorkomt, kunnen tot drie succinylgroepen per vrijgemaakt arabinanfragment op oligo-arabinans worden aangetroffen. Met GalNH2 gesubstitueerde arabinanfragmenten zijn echter niet gesuccinyleerd. Belangrijk is dat in het geval van M. tuberculosis, en waarschijnlijk in alle langzaam groeiende organismen, zowel positieve lading (geprotoneerd GalNH2 als GalNH3+) als negatieve lading (succinyl) aanwezig zijn in de middelste regionen van het arabinan, met name op O-2 van de binnenste 3,5-α-D-Araf eenheden. De succinylresiduen bevinden zich op de niet gemycolyleerde keten. Onlangs is een compleet primair model van arabinogalactaan voorgesteld.