Double-strand break repair mechanisms in Escherichia coli: recent insights

Damir Ðermić
Ruđer Bošković Institute, Division of Molecular Biology, Zagreb, Croatia
Abstract: Om te overleven moeten alle organismen het voortdurend ontstaan van dubbelstrengsbreuken (DSB’s) in hun DNA repareren. Escherichia coli doet dit door RecA-afhankelijke homologe recombinatie (HR), waarbij het RecA-eiwit wordt geassembleerd op een 3´-getermineerde overhang die ontstaat door een proces dat DNA-uiteinde-resectie wordt genoemd. Het RecA nucleoproteïne filament zoekt en dringt binnen in een intacte homologe DNA sequentie, waardoor een centraal HR intermediair ontstaat. Deze review beschrijft recente inzichten in HR en DSB reparatie in E. coli, in het bijzonder de processen die voorafgaan aan de vorming van een RecA nucleoproteïne filament, met de nadruk op de regulatie van het 3´-staart metabolisme. Aangezien HR een sterk geconserveerd proces is, worden de parallellen met DSB herstel in eukaryote systemen besproken, met in het achterhoofd dat de lessen die geleerd worden uit studies in eenvoudigere bacteriële modellen nuttig kunnen zijn voor het bestuderen van DSB herstel en het behoud van genoomstabiliteit in eukaryoten.
Keywords: RecA nucleoproteïne filament, homologe recombinatie, exonucleasen, genoomstabiliteit, 3´-overhang metabolisme