Sequencing van alle 24 menselijke chromosomen brengt zeldzame aandoeningen aan het licht
Vrouwen vragen vaak om niet-invasieve screeningstests om genetische aandoeningen op te sporen. Deze tests zijn echter meestal alleen gericht op het syndroom van Down en andere veel voorkomende trisomieën. Een trisomie is een aandoening waarbij er drie exemplaren van een bepaald chromosoom zijn in plaats van de standaard twee.
“Door onze analyse uit te breiden tot alle chromosomen konden we het risico op ernstige complicaties identificeren en mogelijk vals-positieve resultaten voor het Down-syndroom en andere genetische aandoeningen verminderen,” zei Diana W. Bianchi, M.D., hoofdauteur van de studie en hoofd van de Prenatal Genomics and Therapy Section bij het National Human Genome Research Institute (NHGRI) van het NIH. Dr. Bianchi is ook de directeur van NIH’s Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development (NICHD).
De onderzoekers analyseerden DNA-sequentiegegevens van bijna 90.000 monsters van moederlijk plasma, het vloeibare gedeelte van bloed nadat alle cellen zijn verwijderd. Van deze monsters waren 72.972 afkomstig van een Amerikaans cohort en 16.885 van een Australisch cohort. Voor elk van hen berekenden de onderzoekers een genormaliseerde chromosoomnoemer kwaliteit (NCDQ), die de waarschijnlijkheid meet dat een monster de standaard twee kopieën van elk chromosoom heeft. Degenen met een NCDQ van 50 of lager werden gemarkeerd voor verdere evaluatie.
In het Amerikaanse cohort werden 328 (0,45 procent) monsters gemarkeerd en uiteindelijk geclassificeerd als abnormaal. In het Australische cohort werden 71 (0,42 procent) monsters abnormaal bevonden, waarvan 60 een zeldzame trisomie bevatten. Trisomie 7 werd het vaakst waargenomen in beide studiecohorten, gevolgd door trisomieën 15, 16 en 22.
Volwassenheid en andere uitkomstgegevens waren beschikbaar voor 52 van de 60 gevallen van zeldzame trisomieën die in het Australische cohort werden aangetroffen. Met name koppelden onderzoekers 22 monsters met een vroege miskraam (optredend vóór 11 of 12 weken zwangerschap), waaronder 13 van 14 monsters met trisomie 15 en 3 van 5 monsters met trisomie 22.
“We ontdekten dat zwangerschappen met het grootste risico op ernstige complicaties die waren met zeer hoge niveaus van abnormale cellen in de placenta,” zei Mark D. Pertile, Ph.D., co-eerste auteur van de studie en hoofd van de divisie reproductieve genetica bij Victorian Clinical Genetics Services, onderdeel van Murdoch Childrens Research Institute in Melbourne, Australië. “Onze resultaten suggereren dat patiënten de optie krijgen om testresultaten van alle 24 chromosomen te ontvangen.”
Bij de studie zijn ook auteurs betrokken van Illumina Inc, in Redwood City, Californië.
Reference:
Pertile, M., et al. Rare Autosomal Trisomies, Revealed by Maternal Plasma DNA Sequencing, Suggest Increased Risk of Feto-Placental Disease. Science Translational Medicine 2017.
Het National Human Genome Research Institute (NHGRI) is een van de 27 instituten en centra van het NIH, een agentschap van het Department of Health and Human Services. De NHGRI Division of Intramural Research ontwikkelt en implementeert technologie om genomische en genetische ziekten te begrijpen, te diagnosticeren en te behandelen. Aanvullende informatie over NHGRI is te vinden op: www.genome.gov.
Over de National Institutes of Health (NIH): NIH, de nationale instantie voor medisch onderzoek, omvat 27 instituten en centra en is een onderdeel van het Amerikaanse ministerie van Volksgezondheid en Human Services. NIH is het belangrijkste federale agentschap dat fundamenteel, klinisch en translationeel medisch onderzoek uitvoert en ondersteunt, en onderzoek doet naar de oorzaken, behandelingen en genezing van zowel veel voorkomende als zeldzame ziekten. Voor meer informatie over het NIH en zijn programma’s kunt u terecht op http://www.nih.gov
Contact
Jeannine Mjoseth
NHGRI Communications
301-335-8641