Archenteron
Jak pierwotne komórki mezenchymy odłączają się od bieguna wegetatywnego w gastruli i wchodzą do wypełnionej płynem jamy w centrum (blastocoel), pozostałe komórki na biegunie wegetatywnym spłaszczają się, tworząc płytkę wegetatywną. Ta z kolei zagina się do wewnątrz w kierunku blastocelu w procesie zwanym inwaginacją. Komórki ulegają dalszej przebudowie, aż płytkie zagłębienie powstałe w wyniku inwazji przekształci się w głębszą, węższą torebkę utworzoną przez endodermę gastruli. To zwężanie i wydłużanie się archenteronu jest napędzane przez konwergentne rozszerzanie. Otwarty koniec archenteronu nazywany jest blastoporem.
Filopodia – cienkie włókna utworzone przez komórki mezenchymy – znajdujące się w późnym gastruli kurczą się, aby przeciągnąć końcówkę archenteronu przez blastocel. Endoderma archenteronu połączy się z ektodermą ściany blastocelu. W tym momencie gastrulacja jest zakończona, a gastrula ma funkcjonalny przewód pokarmowy.