Na temat definicji, nomenklatury i klasyfikacji białek kanału wodnego (akwaporyn i krewnych)

Białko kanału wodnego (WCP) lub kanał wodny można zdefiniować jako białko transmembranowe, które ma specyficzną trójwymiarową strukturę z porem, który zapewnia ścieżkę dla przenikania wody przez błony biologiczne. Por jest utworzony przez dwa wysoce konserwowane regiony w sekwencji aminokwasowej, zwane polami NPA (lub motywami) z trzema resztami aminokwasowymi (asparagina-prolina-alanina, NPA) i kilkoma otaczającymi je aminokwasami. Pudełka NPA zostały nazwane sekwencją „sygnaturową” WCP. WCPs to rodzina białek należ±cych do nadrodziny MIPs (Membrane Intrinsic Proteins). Ponadto, w nadrodzinie MIP (liczącej ponad 1000 członków) znajdują się również białka nie wykazujące aktywności kanałowej. Rodzina WCP obejmuje trzy podrodziny: akwaporyny, akwagliceroporyny i S-akwaporyny. (1) Akwaporyny (AQPs) to selektywne lub specyficzne kanały wodne, nazywane też przez różnych autorów „ortodoksyjnymi”, „zwykłymi”, „konwencjonalnymi”, „klasycznymi”, „czystymi”, „normalnymi” lub „sensu stricto” akwaporynami); (2) Akwagliceroporyny przepuszczają wodę, ale także inne małe nienaładowane cząsteczki, w szczególności glicerol; do tej rodziny należą m.in. facylitatory glicerolu, w skrócie GlpFs, od glycerol permease facilitators. Sekwencją „sygnaturową” dla akwagliceroporyn jest reszta kwasu asparaginowego (D) w drugim polu NPA. (3) Trzecia podrodzina WCP posiada mało konserwowane sekwencje aminokwasowe wokół pól NPA, nie dające się zaklasyfikować do dwóch pierwszych podrodzin. Zalecam używanie zawsze dla tej podrodziny nazwy S-aquaporins. Są one również nazywane „superaquaporins”, „aquaporins with unusual (or deviated) NPA boxes”, „subcellular aquaporins”, lub „sip-like aquaporins”. Zalecam też używanie zawsze pisowni akwaporyna (nie akwaporyna), a w przypadku różnych AQP – skrótu AQP, po którym następuje od razu numer (np. AQP1), bez spacji lub – co może powodować pomyłki z „minusem”.