Method paperAlcanivorax borkumensis produz um sideróforo extracelular em condição de limitação de ferro mantendo a eficiência de degradação de hidrocarbonetos -eficiência de degradação

As bactérias hidrocarbonoclásticas marinhas obrigatórias possuem características genéticas e fisiológicas para utilizar os hidrocarbonetos como única fonte de carbono e para competir pela absorção de nutrientes em habitats marinhos normalmente esgotados em nutrientes. No presente trabalho estudamos os sistemas de absorção de ferro à base de sideróforo em Alcanivorax borkumensis SK2 e seu funcionamento durante a biodegradação de um hidrocarboneto alifático, o tetradecano, sob condições de limitação de ferro. A análise antiSMASH do genoma SK2 revelou a presença de dois óperos putativos diferentes de sínteses de sideróforos. A pesquisa das estruturas do núcleo previsto indicou que um sideróforo está claramente afiliado à família dos sideróforos oligopeptídeos complexos possuindo um motivo carboxilo Orn-Ser-Orn, enquanto que o segundo provavelmente pertence à família dos sideróforos SA (ácido salicílico).

Analisando o sobrenadante da cultura SK2, um sideróforo extracelular foi identificado e sua estrutura foi resolvida. Assim, juntamente com o recentemente descrito anfibactino tetrapéptido tetrapeptídico de membrana, a linhagem SK2 produz adicionalmente um tipo extracelular de molécula de ferro com similaridade estrutural às pseudomonas. A análise comparativa de Q-PCR de síntoplastia de sideróforos demonstrou a sua significativa regulação em meio sem ferro. Diferentes padrões de expressão foram registrados para dois óperos durante as fases exponenciais precoce e tardia de crescimento, sugerindo uma função diferente desses dois sideróforos sob condições de ferro-depletado.