Alcanivorax borkumensis produce un siderofor extracelular în condiții de limitare a fierului menținând eficiența degradării hidrocarburilor – ScienceDirect

Bacteriile hidrocarbonoclastice marine obligate posedă caracteristici genetice și fiziologice pentru a utiliza hidrocarburile ca sursă unică de carbon și pentru a concura pentru absorbția de nutrienți în habitate marine de obicei sărace în nutrienți. În lucrarea de față am studiat sistemele de absorbție a fierului bazate pe siderofori la Alcanivorax borkumensis SK2 și funcționarea acestora în timpul biodegradării unei hidrocarburi alifatice, tetradecanul, în condiții de limitare a fierului. Analiza antiSMASH a genomului SK2 a scos la iveală prezența a doi operoni putativi diferiți de sintetaze de siderofori. Căutarea structurilor de bază prezise a indicat că unul dintre siderofori este în mod clar afiliat familiei de siderofori oligopeptidici complecși care posedă un motiv carboxil Orn-Ser-Orn, în timp ce al doilea este probabil să aparțină familiei de siderofori pe bază de SA (acid salicilic).

Analizând supernatantul culturii SK2, a fost identificat un siderofor extracelular și structura sa a fost rezolvată. Astfel, alături de amphibactinul siderophor tetrapeptidic amphibactin tetrapeptidic amphibactin asociat membranei, recent descris, tulpina SK2 produce în plus un tip extracelular de moleculă de chelatizare a fierului cu similitudine structurală cu pseudomoninele. Analiza comparativă Q-PCR a sintetazelor siderofore a demonstrat o creștere semnificativă a reglementării acestora în mediu sărăcit în fier. S-au înregistrat modele de expresie diferite pentru doi operoni în timpul fazelor exponențiale timpurii și târzii de creștere, sugerând o funcție diferită a acestor doi siderofori în condiții de sărăcire a fierului.

.