Capra Black Bengal
Misterul vieții celei mai bune și singure rase de capră Black Bengal din Bangladesh a fost dezvăluit prin secvențierea întregului genom de către „Grupul de cercetare genomică” condus de Dr. AMAM Zonaed Siddiki, profesor al Departamentului de Patologie și Parazitologie, Facultatea de Medicină Veterinară a Universității de Științe Veterinare și Zootehnice din Chittagong (CVASU). Analiza genomului caprei negre de Bengal a arătat că dimensiunea genomului său este de aproximativ 3,04 gb, din care aproximativ 31,85% sunt repetări. Deși se preconizează că există 26 458 de gene în 29 de cromozomi, s-a realizat o adnotare a structurii genice doar pentru 12 589 de gene. În plus, cel puțin un termen ontologic a fost găsit printre 8173 de gene. În prezent, una dintre lucrările de cercetare din cadrul proiectului a fost acceptată și publicată de reputatul jurnal științific BMC sub egida companiei Springer Nature. O altă parte a cercetării a fost publicată în Mitochondrial DNA Part B de Taylor and Francis Group, în plus față de faptul că toate datele au fost recunoscute de NCBI. În plus, în timp ce cercetarea era în desfășurare, rezumatul acesteia a fost prezentat pentru prima dată în cadrul „The 2nd World Conference on Sheep”, organizată de Universitatea Agricolă din Nanjing. Pentru a conduce proiectul cu succes, toți membrii echipei au fost instruiți corespunzător. Pentru o formare suplimentară, unul dintre membrii echipei, Masum Billah, a fost trimis la Laboratorul de Big Data al profesorului Dr. Yu Jiang din cadrul Universității de Nord-Vest A&F din China, iar un alt membru, Kazi Shawrob, a fost trimis la Universitatea Mizoram din India. Ceilalți membri ai echipei au fost Mahadia Kumkum, Mohammad Atique Ul Alam, Sourav Saha Pritthi, Montaha Chowdhury, Mehedi Hasan Rumi și Md. Sirajul Islam.
Pentru analiza datelor, în CVASU a fost instalat un computer de mare viteză de 128 gb RAM și a fost folosit serverul Comisiei pentru subvenții universitare din Bangladesh. Cea mai mare parte a cercetării a fost realizată în Bangladesh, dar pentru unele părți a fost necesar un server foarte avansat, care a fost realizat în Australia de către Dr. Abdul Baten de la Southern Cross University.
Deși secvențierea întregului genom al Hilsha și al iutei a fost realizată anterior în Bangladesh, dimensiunea genomului caprei negre de Bengal este cea mai mare. Genomul este setul complet de gene sau alcătuirea genetică prezentă într-un organism, care este necesară pentru naștere, viață și reproducere. Genele conțin toate informațiile despre organism, cum ar fi modul în care acesta a luat naștere și a evoluat, care sunt caracteristicile sale, cum crește și cum se protejează în situații adverse. Procesul de obținere a tuturor acestor informații din gene se numește secvențierea genomului. Secvențierea genomului ne informează despre localizarea și funcția exactă a genelor care sunt necesare pentru diferite activități fiziologice de la nașterea până la moartea organismului.
.