Transcripția naturală antisens dintr-o perspectivă comparativă☆

Transcripții naturali antisens (NATs) pot interfera cu expresia transcripțiilor complementare de sens cu o specificitate rafinată. Am clonat anterior NAT-uri ale locilor Slc34a (care codifică transportatori de Na-fosfat) de la pește și de la șoarece. Aici raportăm clonarea unui NAT uman înrudit cu SLC34A1, care reprezintă un transcript PFN3 (Profilin3) cu splicing alternativ. Transcriptul este exprimat predominant în testicule. Comparația filogenetică sugerează două mecanisme distincte care produc NAT-uri legate de Slc34a: Splicingul alternativ al unui transcript de la o genă din aval care codifică o proteină (Pfn3, om/șoarece) și transcrierea de la promotorul bidirecțional (Rbpja, pește zebră). Analiza expresiei a sugerat o reglementare independentă a ARNm complementare Slc34a. Analiza lociilor umani/șoareci cu transcriere bidirecțională selectați la întâmplare a relevat o conservare filogenetică limitată și o reglementare independentă a NAT-urilor. Acestea au fost reduse pe cromozomii X și grupate în regiuni care scapă inactivării. Structura locusului și modelul de expresie sugerează un mecanism de reglare asociat NATs în testicule care nu are legătură cu rolul fiziologic al proteinei codificate de transcriptul de sens.

.