Archenteron
Når primære mesenchymceller løsner sig fra den vegetative pol i gastrulaen og går ind i det væskefyldte hulrum i midten (blastocoel), flader de resterende celler ved den vegetative pol ud og danner en vegetativ plade. Denne bukker sig indad mod blastocoelen i en proces, der kaldes invagination. Cellerne fortsætter med at blive omlagt, indtil den lavvandede fordybning, der er dannet ved invagination, forvandles til en dybere, smallere pose, der dannes af gastrulaens endoderm. Denne indsnævring og forlængelse af archenteron er drevet af konvergent udvidelse. Den åbne ende af archenteronet kaldes blastoporen.
Filopodierne – de tynde fibre dannet af mesenchymcellerne – der findes i en sen gastrula trækker sig sammen for at trække spidsen af archenteronet hen over blastocoelen. Archenteronets endoderm vil smelte sammen med ektodermen i blastocoelvæggen. På dette tidspunkt er gastrulation afsluttet, og gastrulaen har et funktionelt fordøjelsesrør.