Double-strand break repair mechanisms in Escherichia coli: recent insights

Damir Ðermić
Ruđer Bošković Institute, Division of Molecular Biology, Zagreb, Croatia
Abstrakt: For at overleve skal alle organismer reparere de kontinuerligt forekommende dobbeltstrengebrud (DSB’er) i deres DNA for at overleve. Escherichia coli gør dette ved RecA-afhængig homolog rekombination (HR), hvor RecA-proteinet samles på et 3´-termineret overhæng, der er skabt ved en proces kaldet DNA-ende resektion. RecA-nukleoproteinfilamentet søger efter og trænger ind i en intakt homolog DNA-sekvens og skaber et centralt HR-mellemled. Denne gennemgang beskriver nyere indsigt i HR og DSB-reparation i E. coli, især de processer, der går forud for dannelsen af et RecA-nukleoproteinfilament, med vægt på reguleringen af 3´-hale-metabolismen. Da HR er en meget bevaret proces, diskuteres parallellerne til DSB-reparation i eukaryote systemer, idet der tages hensyn til, at erfaringerne fra undersøgelser i enklere bakteriemodeller kan være nyttige til at studere DSB-reparation og opretholdelse af genomstabilitet i eukaryoter.
Nøgleord: RecA nucleoproteinfilament, homolog rekombination, exonukleaser, genomstabilitet, 3´-overhang-metabolisme