Naturlig antisense transkription fra et komparativt perspektiv☆

Naturlige antisense transkriptioner (NAT’er) kan forstyrre ekspressionen af komplementære sens-transskriptioner med en udsøgt specificitet. Vi har tidligere klonet NAT’er af Slc34a loci (som koder for Na-fosfattransportere) fra fisk og mus. Her rapporterer vi om kloning af en menneskelig SLC34A1-relateret NAT, som repræsenterer et alternativt splejset PFN3-transkript (Profilin3). Transkriptet er overvejende udtrykt i testis. En fylogenetisk sammenligning tyder på to forskellige mekanismer, der producerer Slc34a-relaterede NAT’er: Alternativ splejsning af et transkript fra et proteinkodende nedstrømsgen (Pfn3, menneske/mus) og transkription fra den tovejs-promotor (Rbpja, zebrafisk). Ekspressionsanalyse tyder på uafhængig regulering af de komplementære Slc34a mRNA’er. Analyse af tilfældigt udvalgte bi-direktionelt transskriberede menneske/mus-loci afslørede begrænset fylogenetisk bevarelse og uafhængig regulering af NAT’er. De var reduceret på X-kromosomer og var grupperet i regioner, der undgår inaktivering. Locusstruktur og ekspressionsmønster tyder på NATs-associerede reguleringsmekanismer i testiklerne, som ikke er relateret til den fysiologiske rolle af proteinet, der er kodet for sense transkriptet.