Sekventering af alle 24 menneskelige kromosomer afdækker sjældne sygdomme
Kvinder anmoder ofte om ikke-invasive screeningstest for at opdage genetiske sygdomme. Disse test fokuserer dog typisk kun på Downs syndrom og andre almindelige trisomier. En trisomi er en tilstand, hvor der er tre forekomster af et bestemt kromosom i stedet for de normale to.
“Ved at udvide vores analyse til alle kromosomer kunne vi identificere risikoen for alvorlige komplikationer og potentielt reducere falsk-positive resultater for Downs syndrom og andre genetiske tilstande”, siger Diana W. Bianchi, M.D., seniorforfatter af undersøgelsen og chef for Prenatal Genomics and Therapy Section ved NIH’s National Human Genome Research Institute (NHGRI). Bianchi er også direktør for NIH’s Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development (NICHD).
Undersøgerne analyserede DNA-sekvensdata fra næsten 90.000 prøver af moderens plasma, den flydende del af blodet, efter at alle celler er blevet fjernet. Af disse prøver kom 72,972 fra en amerikansk kohorte og 16,885 kom fra en australsk kohorte. For hver af dem beregnede forskerne en normaliseret kromosomnævnerkvalitet (NCDQ), som måler sandsynligheden for, at en prøve har de normale to kopier af hvert kromosom. De med en NCDQ på 50 eller derunder blev markeret med henblik på yderligere evaluering.
I den amerikanske kohorte blev 328 (0,45 procent) prøver markeret og i sidste ende klassificeret som unormale. I den australske kohorte blev 71 (0,42 procent) prøver anset for at være unormale, hvoraf 60 indeholdt en sjælden trisomi. Trisomi 7 blev observeret hyppigst i begge undersøgelseskohorter, efterfulgt af trisomier 15, 16 og 22.
Graviditets- og andre udfaldsdata var tilgængelige for 52 af de 60 tilfælde af sjældne trisomier, der blev fundet i den australske kohorte. Især knyttede forskerne 22 prøver med tidlig abort (der forekommer før 11 eller 12 ugers graviditet), herunder 13 ud af 14 prøver med trisomi 15 og 3 ud af 5 prøver med trisomi 22.
“Vi fandt, at graviditeter med størst risiko for alvorlige komplikationer var dem med meget høje niveauer af unormale celler i placenta,” sagde Mark D. Pertile, Ph.D., medførste forfatter af undersøgelsen og leder af afdelingen for reproduktionsgenetik ved Victorian Clinical Genetics Services, der er en del af Murdoch Childrens Research Institute i Melbourne, Australien. “Vores resultater tyder på, at patienterne bør have mulighed for at få testresultater fra alle 24 kromosomer.”
I undersøgelsen indgår også forfattere fra Illumina Inc. i Redwood City, Californien.
Reference:
Pertile, M., et al. Rare Autosomal Trisomies, Revealed by Maternal Plasma DNA Sequencing, Suggest Increased Risk of Feto-Placental Disease. Science Translational Medicine 2017.
The National Human Genome Research Institute (NHGRI) er et af de 27 institutter og centre under NIH, et agentur under Department of Health and Human Services. NHGRI’s Division of Intramural Research udvikler og implementerer teknologi til at forstå, diagnosticere og behandle genomiske og genetiske sygdomme. Yderligere oplysninger om NHGRI kan findes på: www.genome.gov.
Om National Institutes of Health (NIH): NIH, landets agentur for medicinsk forskning, omfatter 27 institutter og centre og er en del af det amerikanske ministerium for sundhed og menneskelige tjenester. NIH er det primære føderale organ, der udfører og støtter grundlæggende, klinisk og translationel medicinsk forskning og undersøger årsager, behandlinger og helbredelsesmetoder for både almindelige og sjældne sygdomme. For yderligere oplysninger om NIH og dets programmer, besøg http://www.nih.gov
Kontakt
Jeannine Mjoseth
NHGRI Communications
301-335-8641