11.7B: Vasta-ainegeenit ja monimuotoisuus
Somaattinen hypermutaatio
Rekombinaation toinen vaihe tapahtuu sen jälkeen, kun B-solu on aktivoitunut antigeenin vaikutuksesta. Näissä nopeasti jakautuvissa soluissa raskaiden ja kevyiden ketjujen muuttuvia domeeneja koodaavissa geeneissä tapahtuu runsaasti pistemutaatioita somaattiseksi hypermutaatioksi (SHM) kutsutussa prosessissa. SHM on solumekanismi, jonka avulla immuunijärjestelmä sopeutuu sitä kohtaaviin uusiin vieraisiin elementteihin, ja se on tärkeä osa affiniteetin kypsymisprosessia. SHM monipuolistaa B-solureseptoreita, joita käytetään antigeenien tunnistamiseen, ja antaa immuunijärjestelmälle mahdollisuuden mukauttaa vasteensa uusiin uhkiin organismin elinaikana. Somaattinen hypermutaatio on ohjelmoitu mutaatioprosessi, joka vaikuttaa immunoglobuliinigeenien muuttuviin alueisiin. SHM johtaa noin yhteen nukleotidimuutokseen muuttuvaa geeniä kohti solunjakautumista kohti. Tämän seurauksena kaikki B-tytärsolut saavat pieniä aminohappoeroja vasta-aineketjujensa muuttuviin alueisiin. Tämä lisää vasta-ainevaraston monimuotoisuutta ja vaikuttaa vasta-aineen antigeeniin sitoutuvaan affiniteettiin. Jotkin pistemutaatiot johtavat sellaisten vasta-aineiden tuottamiseen, joilla on alhaisempi affiniteetti antigeeniinsä kuin alkuperäisellä vasta-aineella, ja jotkin mutaatiot tuottavat vasta-aineita, joilla on korkeampi affiniteetti. B-solut, jotka ilmentävät pinnallaan korkeamman affiniteetin vasta-aineita, saavat voimakkaan selviytymissignaalin vuorovaikutuksessa muiden solujen kanssa, kun taas ne solut, joilla on matalamman affiniteetin vasta-aineita, eivät saa sitä, vaan kuolevat apoptoosin kautta. Näin ollen B-solut, jotka ilmentävät vasta-aineita, joilla on korkeampi affiniteetti antigeeniin, kilpailevat toiminnassa ja selviytymisessä niiden kanssa, joilla on heikompi affiniteetti. Prosessia, jossa syntyy vasta-aineita, joilla on suurempi sitoutumisaffiniteetti, kutsutaan affiniteettikypsytykseksi. Affiniteettikypsyminen tapahtuu V(D)J-rekombinaation jälkeen, ja se on riippuvainen auttaja-T-solujen avusta.
Vasta-ainegeenit järjestäytyvät myös uudelleen prosessissa, jota kutsutaan luokanvaihdokseksi (class switching), jossa raskaan ketjun emäs vaihtuu toiseen. Tämä luo vasta-aineelle erilaisen isotyypin säilyttäen samalla antigeenispesifisen muuttuvan alueen, jolloin yhtä vasta-ainetta voidaan käyttää useissa eri immuunijärjestelmän osissa.