Apoptotic protease activating factor-1 (Apaf-1)

Apoptoosi on ohjelmoidun solukuoleman muoto monisoluisissa eliöissä. Sen toimintahäiriöllä on ratkaiseva merkitys ihmisen eri sairauksissa, kuten syövässä ja neurologisissa rappeutumissairauksissa. Apoptoosiprosessissa apoptosomiksi kutsuttu kompleksi muodostuu apoptoottisesta proteaasin aktivoivasta tekijästä 1 (Apaf-1), prokaspaasi-9:stä ja sytokromi c/dATP:stä. Apoptosomi koostuu seitsemästä Apaf-1-molekyylistä, jotka on järjestetty symmetriseen, pyörän muotoiseen rakenteeseen. Apaf-1 sisältää N-terminaalisen kaspaasin rekrytointidomeenin (CARD), joka vastaa kaspaasi-9:n rekrytoinnista, nukleotidisidoksisen oligomerisaatiodomeenin (NOD) ja 13 WD40-toistoa, joiden ajatellaan olevan vuorovaikutuksessa sytokromi c:n kanssa. Apaf-1:n oligomerisaatio johtaa prokaspaasi-9:n autoaktivoitumiseen, joka vuorostaan pilkkoo kaspaasi-3:n aiheuttaen viime kädessä kuoleman. Apoptosomin rakenne muodostaa näin ollen solun ”kuoleman pyörän” Monissa solutyypeissä apoptosomi on tarpeeton stressin aiheuttaman apoptoosin kannalta, ja sen tehtävänä on pikemminkin vahvistaa kuin käynnistää kaspaasikaskadi, ja sen on oltava tärkeämpi tietyissä solutyypeissä.