Double-strand break repair mechanisms in Escherichia coli: recent insights

Damir Ðermić
Ruđer Bošković -instituutti, molekyylibiologian osasto, Zagreb, Kroatia
Yhteenveto: Selviytyäkseen hengissä kaikkien organismien on korjattava DNA:nsa jatkuvaan ilmaantuviin kaksoissäikeisiin katkeamisiin. Escherichia coli tekee tämän RecA:sta riippuvaisella homologisella rekombinaatiolla (HR), jonka aikana RecA-proteiini kootaan 3´-pääteiseen ylikappaleeseen, joka syntyy DNA:n loppupään resektioksi kutsutussa prosessissa. RecA-nukleoproteiinifilamentti etsii ja tunkeutuu ehjään homologiseen DNA-sekvenssiin, jolloin syntyy keskeinen HR-välikappale. Tässä katsauksessa kuvataan viimeaikaisia näkemyksiä HR- ja DSB-korjauksesta E. colissa, erityisesti RecA-nukleoproteiinifilamentin muodostumista edeltävistä prosesseista, painottaen 3´-hännän metabolian säätelyä. Koska HR on pitkälle konservoitunut prosessi, käsitellään paralleeleja DSB-korjaukseen eukaryoottisissa järjestelmissä pitäen mielessä, että yksinkertaisemmilla bakteerimalleilla tehdyistä tutkimuksista saadut kokemukset voivat olla hyödyllisiä tutkittaessa DSB-korjausta ja genomin vakauden ylläpitoa eukaryooteissa.
Sanoja: RecA-nukleoproteiinifilamentti, homologinen rekombinaatio, eksonukleaasit, genomin stabiilisuus, 3´-overhangin metabolia

.