Aminopeptidase

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  • 1 Função
  • 2 Aminopeptidase da Aeromonas proteolítica
  • 3 S. griseus aminopeptidase
  • 4 Estruturas 3D da Aminopeptidase

Função

Aminopeptidases (AP) (EC 3) são metais – a maioria enzimas dependentes de Zn envolvidas na digestão das proteínas. Cytosol AP (Cyt-AP), AP deblocking (DAP) e AP N (APN) removem os aminoácidos N-terminais. Os AP são classificados pelo aminoácido que eles hidrolisam. Outros tipos de PA são:

  • PA ativado a frio (Col-AP)
  • PA estável ao calor de Thermus thermophilus (AmpT)
  • PA de Staphylococcus aureus (AmpS)
  • SGAP de Stereomyces griseus. Veja detalhes em Streptomyces griseus Aminopeptidase (SGAP).
  • Alanine aminopeptidase é chamada aminopeptidase N. Veja detalhes em Aminopeptidase N.

Aminopeptidases catalisam uma liberação de um aminoácido N-terminal de um peptídeo, amida, ou arilamida. Beta-peptidyl AP (BapA) clivagem N-terminal β-homoamino ácido de peptídeos de comprimento 2 a 6,

Aminopeptidase de Aeromonas proteolytica

A inibição seletiva de uma , uma hidrolase, por derivados é relatada. Com base em nossos achados sobre os fluoróforos Zn2+ baseados em 8-HQ, foi feita a hipótese de que os derivados de 8-HQ têm o potencial de funcionar como inibidores específicos das enzimas Zn2+, especialmente das hidrolases dinucleares Zn2+. Ensaios inibitórios de derivados de 8-HQ contra a AAP revelaram que o 8-HQ e o 5-substituído 8-HQ′s são inibidores competitivos para a AAP com constantes de inibição (Ki) de 0,16-29 μM a pH 8,0. (1,3 Å resolução) bem como as titulações fluorescentes destes medicamentos com AAP confirmaram que , no qual o no local ativo da AAP e o (código PDB: 3vh9). de AAP livre (verde colorido) contendo Zn2+-molécula de água (H2O ou OH-; esfera vermelha) (1rtq) ligando dois complexos Zn2+ e AAP-8-HQ (magenta escura, 3vh9). Duas Zn2+ são representadas como esferas magenta.

S. griseus aminopeptidase

S. griseus aminopeptidase (SGAP) clivam o aminoácido N-terminal de um peptídeo ou proteína, e é específico para ácidos hidrofóbicos maiores, especialmente leucina. Não ocorre clivagem se o próximo resíduo for prolina.

A da enzima contém dois íons Zn2+ com His85 e Asp160 como ligantes para um íon, e Glu132 e His247 como ligantes para o segundo íon. Asp97 é um ligando comum aos dois íons. O que parece ser um anião fosfato está ligado a ambos os átomos de zinco, substituindo a molécula de água/ião hidróxido normalmente encontrado nesta classe de enzimas. Ver detalhes de SGAP em Streptomyces griseus Aminopeptidase (SGAP).

Estruturas 3D da Aminopeptidase

Estruturas 3D da Aminopeptidase