Archenteron
As células mesenquimais primárias destacam-se do pólo vegetal na gastrula e entram na cavidade cheia de fluido no centro (o blastocoel), as células restantes no pólo vegetal achatam-se para formar uma placa vegetal. Este fivela para dentro em direção ao blastocoel em um processo chamado invaginação. As células continuam a ser reordenadas até que o mergulho raso formado pela invaginação se transforme em uma bolsa mais profunda e estreita formada pelo endoderme da gastrula. Este estreitamento e alongamento do arquétron é impulsionado por uma extensão convergente. A extremidade aberta do arquétrio é chamada de blastopore.
As fibras filopodiafinas formadas pelas células mesenquimais – encontradas numa gastrula tardia – para arrastar a ponta do archenteron através do blastocoel. O endoderme do arcentro se fundirá com o ectoderme da parede do blastocoel. Neste ponto a gastrulação está completa, e a gastrula tem um tubo digestivo funcional.