Natural antisense transcription from a comparative perspective☆

Natural antisense transcripts (NATs) pode interferir com a expressão de transcrições de sentidos complementares com uma especificidade requintada. Já clonamos anteriormente NATs de Slc34a loci (codificando transportadores de Na-fosfato) de peixes e ratos. Aqui relatamos a clonagem de um NAT humano relacionado ao SLC34A1 que representa uma transcrição PFN3 emendada alternadamente (Profilin3). A transcrição é predominantemente expressa em testis. A comparação filogenética sugere dois mecanismos distintos que produzem NATs relacionados com a SLC34a-: Emenda alternativa de uma transcrição de um gene de codificação de proteínas a jusante (Pfn3, humano/mouse) e transcrição do promotor bidirecional (Rbpja, zebrafish). A análise de expressão sugeriu a regulação independente das Slc34a mRNAs complementares. A análise dos loci bi-direccionais transcritos humanos/mouse seleccionados aleatoriamente revelou uma conservação filogenética limitada e uma regulação independente dos NATs. Eles foram reduzidos nos cromossomos X e agrupados em regiões que escapam à inativação. A estrutura do locus e o padrão de expressão sugerem mecanismos regulatórios associados à NAT em testículos sem relação com o papel fisiológico da proteína codificada na transcrição do sentido.