Sobre a definição, nomenclatura e classificação das proteínas do canal de água (aquaporinas e familiares)

Uma proteína do canal de água (WCP) ou um canal de água pode ser definida como uma proteína transmembrana que tem uma estrutura tridimensional específica com um poro que fornece um caminho para a permeação da água através das membranas biológicas. O poro é formado por duas regiões altamente conservadas na sequência de aminoácidos, chamadas caixas de NPA (ou motivos) com três resíduos de aminoácidos (asparagina-prolinaalanina, NPA) e vários aminoácidos circundantes. As caixas de NPA têm sido chamadas de sequência de “assinatura” de WCPs. Os WCPs são uma família de proteínas pertencentes à superfamília Membrane Intrinsic Proteins (MIPs). Além disso, na superfamília PIM (com mais de 1000 membros) também existem proteínas sem atividade de canal. A família WCP inclui três subfamílias: aquaporinas, aquagliceroporinas e S-aquaporinas. (1) As aquaporinas (AQPs) são canais de água seletivos ou específicos, também nomeados por vários autores como “ortodoxos”, “ordinários”, “convencionais”, “clássicos”, “puros”, “normais” ou “sensu strictu” aquaporinas); (2) As aquagliceroporinas são permeáveis à água, mas também a outras pequenas moléculas não carregadas, em particular o glicerol; esta família inclui os facilitadores de glicerol, abreviados como GlpFs, a partir dos facilitadores de permeação de glicerol. A sequência de “assinatura” para as aquagliceroporinas é o resíduo de ácido aspártico (D) na segunda caixa de NPA. (3) A terceira subfamília de WCPs tem poucas sequências de aminoácidos conservados ao redor das caixas de NPA, não classificáveis para as duas primeiras subfamílias. Eu recomendo usar sempre para esta subfamília o nome S-aquaporins. Também se chamam “superaquaporinas”, “aquaporinas com caixas de NPA invulgares (ou desviadas)”, “aquaporinas subcelulares”, ou “aquaporinas tipo sip”. Também recomendo usar sempre a ortografia aquaporina (não aquaporina), e, para vários AQPs, a abreviatura AQP seguida imediatamente pelo número, (ex. AQP1), sem espaço ou… o que pode criar confusões com “menos”.