Double-strand break repair mechanisms in Escherichia coli: recent insights
Damir Ðermić
Ruđer Bošković Institute, Division of Molecular Biology, Zagreb, Croatia
Abstrakt: För att överleva måste alla organismer reparera de kontinuerligt uppkomna dubbelsträngsbrotten (DSBs) i sitt DNA. Escherichia coli gör detta genom RecA-beroende homolog rekombination (HR), under vilken RecA-proteinet monteras på ett 3´-terminerat överhäng som skapas genom en process som kallas DNA-endresektion. RecA-nukleoproteinfilamentet söker efter och invaderar en intakt homolog DNA-sekvens, vilket skapar en central HR-intermediär. I denna översikt beskrivs nya insikter om HR- och DSB-reparation i E. coli, särskilt de processer som föregår bildandet av en RecA-nukleoproteinfilament, med tonvikt på regleringen av 3´-tailmetabolismen. Eftersom HR är en mycket bevarad process diskuteras parallellerna till DSB-reparation i eukaryota system, med tanke på att lärdomarna från studier i enklare bakteriemodeller kan vara användbara för att studera DSB-reparation och upprätthållandet av genomets stabilitet i eukaryoter.
Nyckelord: RecA nukleoproteinfilament, homolog rekombination, exonukleaser, genomstabilitet, 3´-overhang-metabolism
.