Sekvensering av alla 24 mänskliga kromosomer avslöjar sällsynta sjukdomar

Kvinnor begär ofta icke-invasiva screeningtester för att upptäcka genetiska sjukdomar. Dessa tester fokuserar dock vanligtvis endast på Downs syndrom och andra vanliga trisomier. En trisomi är ett tillstånd där det finns tre förekomster av en viss kromosom i stället för de vanliga två.

”Genom att utvidga vår analys till alla kromosomer kunde vi identifiera risken för allvarliga komplikationer och potentiellt minska falskt positiva resultat för Downs syndrom och andra genetiska tillstånd”, säger Diana W. Bianchi, läkare, försteförfattare till studien och chef för sektionen för prenatala genomik- och terapisystem vid NIH:s National Human Genome Research Institute (NHGRI). Dr Bianchi är också chef för NIH:s Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development (NICHD).

Forskarna analyserade DNA-sekvensdata från nästan 90 000 prover av mammans plasma, den flytande delen av blodet efter att alla celler har avlägsnats. Av dessa prover kom 72 972 från en amerikansk kohort och 16 885 från en australisk kohort. För var och en av dem beräknade forskarna en normaliserad kromosombenämnarkvalitet (NCDQ), som mäter sannolikheten för att ett prov har de vanliga två kopiorna av varje kromosom. De med en NCDQ på 50 eller lägre flaggades för vidare utvärdering.

I den amerikanska kohorten flaggades 328 (0,45 procent) prover och klassificerades slutligen som onormala. I den australiska kohorten bedömdes 71 (0,42 procent) prover som onormala, varav 60 innehöll en sällsynt trisomi. Trisomi 7 observerades mest frekvent i båda studiekohorterna, följt av trisomi 15, 16 och 22.

Graviditetsdata och andra utfallsdata fanns tillgängliga för 52 av de 60 fall av sällsynta trisomier som hittades i den australiska kohorten. Framför allt kopplade forskarna samman 22 prover med tidigt missfall (före 11 eller 12 veckors graviditet), inklusive 13 av 14 prover med trisomi 15 och 3 av 5 prover med trisomi 22.

”Vi fann att graviditeter med störst risk för allvarliga komplikationer var de med mycket höga nivåer av onormala celler i moderkakan”, säger Mark D. Pertile, Ph.D., Medförfattare till studien och chef för avdelningen för reproduktionsgenetik vid Victorian Clinical Genetics Services, en del av Murdoch Childrens Research Institute i Melbourne, Australien. ”Våra resultat tyder på att patienterna bör ges möjlighet att få testresultat från alla 24 kromosomer.”

I studien ingår även författare från Illumina Inc. i Redwood City, Kalifornien.

Referens:

Pertile, M., et al. Rare Autosomal Trisomies, Revealed by Maternal Plasma DNA Sequencing, Suggest Increased Risk of Feto-Placental Disease. Science Translational Medicine 2017.

The National Human Genome Research Institute (NHGRI) är ett av 27 institut och centra vid NIH, ett organ inom Department of Health and Human Services. NHGRI Division of Intramural Research utvecklar och tillämpar teknik för att förstå, diagnostisera och behandla genomiska och genetiska sjukdomar. Ytterligare information om NHGRI finns på följande webbplats: www.genome.gov.

Om National Institutes of Health (NIH): NIH, landets organ för medicinsk forskning, omfattar 27 institut och centra och är en del av USA:s Department of Health and Human Services. NIH är det främsta federala organet som bedriver och stöder grundläggande, klinisk och translationell medicinsk forskning och undersöker orsaker, behandlingar och botemedel för både vanliga och sällsynta sjukdomar. För mer information om NIH och dess program, besök http://www.nih.gov

Kontakt

Jeannine Mjoseth
NHGRI Communications
301-335-8641

.