Svart bengalget

Mysteriet om livet hos världens bästa och enda ras av svart bengalget i Bangladesh har avslöjats genom sekvensering av hela arvsmassan av ”Genomics Research Group” under ledning av Dr. AMAM Zonaed Siddiki, professor vid institutionen för patologi och parasitologi, veterinärmedicinska fakulteten vid Chittagong Veterinary and Animal Sciences University (CVASU). Genomanalysen av Black Bengal Goat har visat att dess genom är cirka 3,04 gb, varav cirka 31,85 % är upprepningar. Även om det förutspås att det finns 26 458 gener i 29 kromosomer, har endast 12 589 gener annoterats med avseende på genstrukturen. Dessutom hittades minst en ontologiterm bland 8173 gener. För närvarande har en av projektets forskningsartiklar godkänts och publicerats av den välrenommerade vetenskapliga tidskriften BMC under företaget Springer Nature. En annan del av forskningen har publicerats i Mitochondrial DNA Part B av Taylor and Francis Group förutom att alla data har erkänts av NCBI. Under forskningens gång presenterades dessutom dess sammanfattning för första gången på ”The 2nd World Conference on Sheep” som anordnades av Nanjing Agricultural University. För att genomföra projektet på ett framgångsrikt sätt utbildades alla medlemmar i teamet i enlighet med detta. För ytterligare utbildning skickades en av gruppens medlemmar, Masum Billah, till Big Data Laboratory of Professor Dr. Yu Jiang vid Northwest A&F University of China och en annan medlem, Kazi Shawrob, skickades till Mizoram University of India. De andra medlemmarna i teamet var Mahadia Kumkum, Mohammad Atique Ul Alam, Sourav Saha Pritthi, Montaha Chowdhury, Mehedi Hasan Rumi och Md. Sirajul Islam.

För dataanalysen installerades en höghastighetsdator med 128 gb RAM i CVASU och servern från University Grants Commission of Bangladesh användes. Det mesta av forskningen utfördes i Bangladesh, men för vissa delar krävdes en mycket avancerad server som utfördes i Australien av dr Abdul Baten från Southern Cross University.

Tyvärr har sekvensering av hela arvsmassan för Hilsha och Jute gjorts tidigare i Bangladesh, men arvsmassan för den svarta bengaliska geten är den största. Genomet är den fullständiga uppsättning gener eller genetiska sammansättning som finns i en organism och som är nödvändig för födelse, liv och fortplantning. Generna innehåller all information om organismen, t.ex. hur den uppstod och utvecklades, vilka egenskaper den har, hur den växer och hur den skyddar sig i ogynnsamma situationer. Processen för att få fram all denna information från generna kallas genomsekvensering. Genomsekvensering berättar om den exakta placeringen och funktionen av de gener som är nödvändiga för olika fysiologiska aktiviteter från en organisms födelse till dess död.