Černá bengálská koza

Záhadu života nejlepšího a jediného plemene černé bengálské kozy na světě v Bangladéši odhalila pomocí sekvenování celého genomu „Genomics Research Group“ vedená Dr. AMAM Zonaedem Siddikim, profesorem katedry patologie a parazitologie na Fakultě veterinárního lékařství Univerzity veterinárních a živočišných věd v Chittagongu (CVASU). Analýza genomu černé bengálské kozy ukázala, že velikost jejího genomu je přibližně 3,04 gb, z čehož přibližně 31,85 % tvoří opakování. Ačkoli se předpokládá, že v 29 chromozomech je 26 458 genů, anotace genové struktury je provedena pouze u 12 589 genů. Kromě toho byl mezi 8173 geny nalezen alespoň jeden ontologický termín. V současné době byla jedna z výzkumných prací projektu přijata a publikována v renomovaném vědeckém časopise BMC pod hlavičkou společnosti Springer Nature. Další část výzkumu byla publikována v časopise Mitochondrial DNA Part B společnosti Taylor and Francis Group a kromě toho byla všechna data uznána NCBI. Kromě toho byl v době, kdy výzkum probíhal, jeho abstrakt poprvé prezentován na „The 2nd World Conference on Sheep“ pořádané Nanjing Agricultural University. Pro úspěšné vedení projektu byli všichni členové týmu náležitě proškoleni. Za účelem dalšího vzdělávání byl jeden z členů týmu, Masum Billah, vyslán do Laboratoře velkých dat profesora Dr. Yu Jianga na Severozápadní A&F univerzitě v Číně a další člen, Kazi Shawrob, byl vyslán na Mizoramskou univerzitu v Indii. Dalšími členy týmu byli Mahadia Kumkum, Mohammad Atique Ul Alam, Sourav Saha Pritthi, Montaha Chowdhury, Mehedi Hasan Rumi a Md. Sirajul Islam.

Pro analýzu dat byl v CVASU instalován vysokorychlostní počítač se 128 gb RAM a byl použit server University Grants Commission of Bangladesh. Většina výzkumu byla provedena v Bangladéši, ale pro některé části byl zapotřebí velmi pokročilý server, který byl proveden v Austrálii Dr. Abdulem Batenem z Southern Cross University.

Přestože sekvenování celého genomu hilša a juty bylo v Bangladéši provedeno již dříve, velikost genomu černé bengálské kozy je největší. Genom je kompletní soubor genů neboli genetická výbava přítomná v organismu, která je nezbytná pro zrození, život a rozmnožování. Geny obsahují veškeré informace o organismu, například jak vznikl a vyvinul se, jaké jsou jeho vlastnosti, jak roste a jak se chrání v nepříznivých situacích. Proces získávání všech těchto informací z genů se nazývá sekvenování genomu. Sekvenování genomu vypovídá o přesném umístění a funkci genů, které jsou nezbytné pro různé fyziologické činnosti od zrození organismu až po jeho smrt

.