Arabinogalaktan
Redukující konec mikrobiálního arabinogalaktanu tvoří koncová sekvence →5)-D-Galf-(1→4)-L-Rhap-(1→3)-D-GlcNAc. Ve funkční skupině peptidoglykanu se nachází také muramyl-6-P. Mykolylarabinogalaktan mykobakterií je připojen k peptidoglykanu pomocí diglykosylfosforylového můstku specifického pro aktinomycety, L-Rhap-(1→3)-D-GlcNAc-(1→P).
Arabinogalaktan obsahuje galaktanový řetězec se střídavě 5-vázanými β-D-galaktofuranosylovými (Galf) a 6-vázanými β-D-Galf zbytky. Arabinanové řetězce jsou navázány na C-5 některých 6-vazných zbytků Galf. Existují tři hlavní strukturní domény arabinanu. První je doména sestávající z lineárních 5-vazných α-D-Arafových zbytků. Druhou je doména s rozvětvenými 3,5 navázanými zbytky α-D-Araf substituovanými 5 navázanými jednotkami α-D-Araf v obou rozvětvených polohách a třetí je terminální neredukující doména pro koncový arabinan sestávající z 3,5 navázaného zbytku α-D-Araf substituovaného v obou rozvětvených polohách disacharidem β-D Araf-(1→2)- α-D-Araf. Tyto tři arabinanové řetězce jsou připojeny ke galaktanu na zbytcích 8, 10 a 12.
Neredukující konec arabinogalaktanu je kovalentně připojen k mykolovým kyselinám vnější membrány. Hydrofobnost mykolových kyselin je bariérou pro vstup léčiva. Kromě toho je mykolický peptidoglykan arabinogalaktan zodpovědný za aspekty patogeneze onemocnění a velkou část protilátkové odpovědi při infekcích. Mykolilové substituenty jsou selektivně a rovnoměrně rozmístěny na 5-hydroxylových funkcích terminálních a předposledních 2-vazných zbytků Araf. Mykolilové zbytky jsou seskupeny ve skupinách po čtyřech na neredukující terminální pentaarabinosylové jednotce (β-Araf-(1→2)-α-Araf)2-3,5-α-Araf . Většina (66 %) pentaarabinosylových jednotek je tedy substituována mykolovými kyselinami, takže menšina (33 %) je k dispozici pro interakci s imunitním systémem.
Přibližně jeden ze tří arabinosylových řetězců připojených ke galaktanovému řetězci obsahuje sukcinylové skupiny. Ačkoli nejčastěji se vyskytuje jedna sukcinylová skupina, na oligo-arabinanech lze nalézt až tři sukcinylové skupiny na uvolněný arabinanový fragment. Arabinanové fragmenty substituované GalNH2 však nejsou sukcinylované. Důležité je, že v případě M. tuberculosis a pravděpodobně u všech pomalu rostoucích organismů je ve středních oblastech arabinanu, konkrétně na O-2 vnitřních jednotek 3,5-α-D-Araf, přítomen jak kladný náboj (protonovaný GalNH2 jako GalNH3+), tak záporný náboj (sukcinyl). Sukcinylové zbytky jsou na nemykolylovaném řetězci. Nedávno byl navržen úplný primární model arabinogalaktanu
.