Archenteron
Když se buňky primárního mezenchymu oddělí od vegetativního pólu v gastrule a vstoupí do tekutinou vyplněné dutiny uprostřed (blastocoel), zbývající buňky na vegetativním pólu se zploští a vytvoří vegetativní desku. Ta se v procesu zvaném invaginace vyklene dovnitř směrem k blastocoelu. Buňky se dále přeskupují, dokud se mělký ponor vzniklý invaginací nezmění v hlubší a užší váček tvořený endodermem gastruly. Toto zužování a prodlužování archenteronu je poháněno konvergentním prodlužováním. Otevřený konec archenteronu se nazývá blastopor.
Filopodie – tenká vlákna tvořená buňkami mezenchymu – nacházející se v pozdní gastrule se smršťují a táhnou špičku archenteronu přes blastocel. Endoderm archenteronu splyne s ektodermem stěny blastocoelu. V tomto okamžiku je gastrulace dokončena a gastrula má funkční trávicí trubici.