Double-strand break repair mechanisms in Escherichia coli: recent insights

Damir Ðermić
Ruđer Bošković Institute, Division of Molecular Biology, Zagreb, Croatia
Abstrakt: Aby přežily, musí všechny organismy opravovat neustálý výskyt dvouřetězcových zlomů (DSB) ve své DNA. Escherichia coli to dělá pomocí homologní rekombinace (HR) závislé na RecA, během níž se protein RecA sestavuje na 3´-koncovém převisu, který vzniká procesem zvaným resekce konce DNA. Nukleoproteinové vlákno RecA vyhledá a napadne neporušenou homologní sekvenci DNA a vytvoří centrální meziprodukt HR. Tento přehled popisuje nejnovější poznatky o HR a opravě DSB v E. coli, zejména procesy, které předcházejí vytvoření nukleoproteinového vlákna RecA, s důrazem na regulaci metabolismu 3´-ocasů. Vzhledem k tomu, že HR je vysoce konzervovaný proces, jsou diskutovány paralely s opravou DSB v eukaryotických systémech, přičemž je třeba mít na paměti, že poznatky získané ze studií na jednodušších bakteriálních modelech mohou být užitečné pro studium opravy DSB a udržování stability genomu u eukaryot.
Klíčová slova: HR je vysoce konzervativní proces: RecA nukleoproteinové vlákno, homologní rekombinace, exonukleázy, stabilita genomu, metabolismus 3´-overhangů

.