O definici, nomenklatuře a klasifikaci proteinů vodních kanálů (aquaporinů a příbuzných proteinů)

Protein vodního kanálu (WCP) nebo vodní kanál lze definovat jako transmembránový protein, který má specifickou trojrozměrnou strukturu s pórem, který zajišťuje cestu pro prostup vody přes biologické membrány. Pór je tvořen dvěma vysoce konzervovanými oblastmi v aminokyselinové sekvenci, které se nazývají NPA boxy (nebo motivy) se třemi aminokyselinovými zbytky (asparagin-prolin-alanin, NPA) a několika okolními aminokyselinami. Boxy NPA byly nazvány „podpisovou“ sekvencí WCP. WCP jsou rodinou proteinů patřících do nadrodiny Membrane Intrinsic Proteins (MIPs). Kromě toho v nadrodině MIP (s více než 1000 členy) existují také proteiny bez kanálové aktivity. Rodina WCP zahrnuje tři podrodiny: aquaporiny, aquaglyceroporiny a S-aquaporiny. (1) Akvaporiny (AQP) jsou vodoselektivní nebo specifické vodní kanály, různými autory nazývané také jako „ortodoxní“, „obyčejné“, „konvenční“, „klasické“, „čisté“, „normální“ nebo „sensu strictu“ akvaporiny); (2) Akvaglyceroporiny jsou propustné pro vodu, ale také pro další malé nenabité molekuly, zejména glycerol; do této rodiny patří glycerolové facilitátory, zkráceně označované jako GlpF, z anglického glycerol permease facilitators. „Podpisovou“ sekvencí pro akvaglyceroporiny je zbytek kyseliny asparagové (D) ve druhém poli NPA. (3) Třetí podčeleď WCP má málo konzervované aminokyselinové sekvence kolem NPA boxů, nezařaditelné k prvním dvěma podčeledím. Doporučuji pro tuto podrodinu používat vždy název S-aquaporiny. Nazývají se také „superaquaporiny“, „aquaporiny s neobvyklými (nebo vychýlenými) NPA boxy“, „subcelulární aquaporiny“ nebo „sip-like aquaporiny“. Doporučuji také používat vždy pravopisný název aquaporin (nikoli aquaporine) a pro různé AQP zkratku AQP, za níž bezprostředně následuje číslo, (např. AQP1), bez mezery nebo – což by mohlo vyvolat záměnu s „minus“.