Přirozená antisense transkripce ze srovnávací perspektivy☆

Přirozené antisense transkripty (NAT) mohou zasahovat do exprese komplementárních sense transkriptů s vynikající specifičností. Již dříve jsme klonovali NATs lokusů Slc34a (kódujících Na-fosfátové transportéry) z ryb a myší. Zde uvádíme klonování lidského NAT příbuzného SLC34A1, který představuje alternativně sestřihaný transkript PFN3 (Profilin3). Tento transkript je převážně exprimován ve varlatech. Fylogenetické srovnání naznačuje dva odlišné mechanismy vzniku NAT příbuzných Slc34a: Alternativní sestřih transkriptu z proteinu kódujícího následný gen (Pfn3, člověk/myš) a transkripce z obousměrného promotoru (Rbpja, zebřička). Analýza exprese naznačila nezávislou regulaci komplementárních mRNA Slc34a. Analýza náhodně vybraných obousměrně transkribovaných lokusů člověk/myš odhalila omezenou fylogenetickou konzervaci a nezávislou regulaci NAT. Byly redukovány na chromozomech X a shlukovaly se v oblastech, které unikají inaktivaci. Struktura lokusů a vzor exprese naznačují regulační mechanismy spojené s NATs ve varlatech, které nesouvisí s fyziologickou úlohou proteinu kódovaného smyslovým transkriptem.

.